2019, 46(11):2944-2951.DOI: 10.13344/j.microbiol.china.190215CSTR: 32113.14.j.MC.190215
摘要:【背景】PilZ结构域是最早发现的环二鸟苷酸(Cyclic diguanylate,c-di-GMP)受体信号分子,与c-di-GMP结合后可以调控目标基因或者蛋白的活性,在细菌的生长过程中发挥着至关重要的作用,而短短芽孢杆菌中PilZ结构域的研究相对缺乏。【目的】挖掘短短芽孢杆菌GZDF3菌株中的PilZ结构域蛋白基因,并进行重组表达,为研究其功能奠定基础。【方法】从Pfam数据库中下载PilZ结构域模型,HMMScan软件扫描GZDF3全基因组序列,在保守结构域数据库(Conserved domain database,CDD)中分析蛋白保守结构域,Protein BLAST比对分析;采用ExPASy在线软件预测蛋白的基本理化性质;构建重组表达载体进行蛋白重组表达。【结果】GZDF3基因中存在5个含有PilZ结构域的蛋白编码基因,其中命名为Gene4836的基因经Protein BLAST比对分析显示其编码糖基转移酶,Gene1423为YcgR超家族蛋白编码基因,Gene1723编码透明质酸合成酶,属于糖基转移酶超家族2,其余Gene2571、Gene2956编码假定蛋白;Gene4836的编码产物分子量为24.08 kD,等电点为6.39,为酸性亲水性蛋白;C端有一个PilZ结构域;0.5 mmol/L乳糖诱导、30 °C培养20 h,表达出一大小约为25 kD的重组蛋白,与生物信息学预测结果相符。【结论】首次对短短芽孢杆菌含有PilZ结构域蛋白编码基因进行原核表达,并成功纯化出重组蛋白,为后续研究其功能奠定了基础。
2025, 52(1):337-349.DOI: 10.13344/j.microbiol.china.240342
摘要:【背景】2,2-联吡啶类天然产物是一类由放线菌产生的抗菌化合物,抑制真菌活性显著,结构特征为包含2,2-联吡啶片段。该类化合物未发现经后修饰的失活产物,其自抗性机制尚未明确。【目的】通过分离纯化并鉴定2,2-联吡啶类化合物的后修饰产物,测试其抗真菌活性,评价后修饰对抗真菌活性的影响,初步探求2,2-联吡啶类化合物存在的自我保护机制。【方法】利用纸片扩散法筛选对真菌有拮抗能力的放线菌并分离纯化该菌株;通过基因组测序及分析对其进行鉴定;利用硅胶柱色谱、高效液相色谱等手段分离纯化目标化合物,通过核磁共振波谱和质谱鉴定其结构;测定目标化合物抗真菌活性;最后通过序列比对来分析推测糖基转移酶。【结果】在链霉菌(Streptomyces sp.) HKIB0006中鉴定了2个2,2-联吡啶类化合物。其中一个为新结构11-O-gluconicacid-collismycin A (1),为已知抗生素collismycin A (2)的11位葡萄糖酸修饰产物,实验表明1的抗真菌活性消失。【结论】对化合物1和2进行抗菌活性测试,活性测试发现葡萄糖酸修饰导致1的抗菌活性丧失,推测葡萄糖酸修饰可能是2,2-联吡啶类化合物的一种自抗性机制,该修饰可能是菌株HKIB0006在与2长期共存中进化出的自我保护策略之一。
2011, 38(2):221-227.
摘要:糖基转移酶在天然产物的糖基化修饰过程中起关键作用。目前链霉菌源抗肿瘤抗生素美达霉素(Medermycin)生物合成途径中的糖基转移酶Med-ORF8 的原核表达及酶学性质还未有研究。首先通过结构模拟确定Med-ORF8 的端部加上His-标签不会影响其三维结构的正确折叠, 然后利用2 种pET 原核表达载体来进行Med-ORF8 的原核表达, 发现以pET-28a (+)为载体进行表达时, 目的蛋白产量非常高, 但是以不可溶的包涵体形式为主。当分子伴侣基因(编码大肠杆菌触发因子)与Med-ORF8 的编码基因共表达时, 在优化诱导条件的情况下, 可以有效减少包涵体的形成,提高了Med-ORF8 的可溶性表达效率, 为Med-ORF8 的酶学分析打下基础。
2020, 47(2):615-622.DOI: 10.13344/j.microbiol.china.190295CSTR: 32113.14.j.MC.190295
摘要:环糊精葡萄糖基转移酶(cyclodextrin glycosyltransferase,CGTase)酶法合成环糊精是目前生产环糊精的主要方法。本文介绍了用于生产环糊精葡萄糖基转移酶的几种工程菌株:大肠杆菌、枯草芽孢杆菌以及毕赤酵母,其中大肠杆菌是目前应用最广泛的用于表达CGTase的表达系统。除此之外,本文还总结了高效表达环糊精葡萄糖基转移酶的有效策略:选择合适的表达载体、启动子以及信号肽,以及密码子优化和分子伴侣共表达,以期为在相关CGTase研究领域开展研究提供参考。
2017, 44(3):601-610.DOI: 10.13344/j.microbiol.china.160257CSTR: 32113.14.j.MC.160257
摘要:【目的】研究不同的信号肽和化学通透剂对重组环糊精葡萄糖基转移酶(CGTase)胞外分泌的影响,提高CGTase的胞外分泌量。【方法】扩增地芽孢杆菌CHB1 (Geobacillus sp. CHB1)的CGTase基因,构建带有地芽孢杆菌CHB1自身信号肽、OmpA、PelB信号肽和不带信号肽的4种重组质粒;比较4种重组质粒对重组CGTase胞外分泌的影响,筛选最优的信号肽;考察甘氨酸、Triton X-100、SDS和Tween 80四种化学通透剂对重组CGTase胞外分泌的影响,确定最佳的化学通透剂及其浓度。【结果】OmpA信号肽介导的分泌效果最好,胞外酶活达到7.44 U/mL,分别是PelB、CHB1信号肽的2.04倍和11.27倍,不带信号肽的重组质粒菌胞外检测不到酶活;携带OmpA信号肽的重组质粒菌发酵48 h,同时添加浓度为0.6%的甘氨酸和0.3%的Triton X-100,胞外酶活达最大到14.27 U/mL;SDS和Tween 80对该酶的胞外分泌具有明显的抑制作用。【结论】OmpA信号肽的介导效果最佳,同时添加浓度为0.6%和0.3%的甘氨酸和Triton X-100可以有效促进胞外分泌,为该重组酶的高效胞外分泌提供了一种有效的方法。