2008, 35(7):1001-1006.
摘要:本文利用RT-PCR方法从转录水平上分别对A. ferrooxidans ATCC 23270基因组中可能编码硫酸盐-硫代硫酸盐结合蛋白基因sbp、膜结合硫代硫酸盐-辅酶Q氧化还原酶基因doxDA以及类硫氰酸酶基因p21等开放阅读框所在的基因座之间的联系进行了鉴定和分析, 结果表明它们分别从属于预测的doxDA-1操纵元和doxDA-2操纵元。在此基础上, 本文对doxDA操纵元的可能启动子序列也进行了预测和分析。
2008, 35(10):1538-1543.
摘要:采用reverse transcriptase PCR 技术, 研究了嗜酸氧化亚铁硫杆菌(Acidithiobacillus ferrooxidans)标准菌株ATCC23270中铜代谢基因Afe0329的转录子情况; 用Vector NTI、Blast、TMHMM Server和PSORTb等软件对此转录子中的各基因做了进一步的生物信息学分析; 并用此转录子的引物扩增多种细菌DNA, 以鉴定此转录元件在A. ferrooxidans菌株基因组中的普遍性。结果表明基因Afe0329, Afe0330和Afe0331一起转录, 处于同一个转录子; 基因Afe0329为编码定位于膜上P1b3型ATP酶基因, Afe0330为编码定位于细胞质中的蛋白基因, Afe0330和Afe0331的Blast分析都没有意义的同源性序列; 且此转录元件普遍存在于A. ferrooxidans菌株基因组中。
2007, 34(5):0921-0925.
摘要:采用平板划线分离法,从江西某铜矿酸性矿坑水中分离出一株极端嗜酸、又能耐受中度碱性条件的异养微生物,命名为HJM菌株。该菌株能在pH1.5~10.0的范围内生长。形态学以及18S rDNA和26S rDNA D1/D2区序列分析表明,HJM菌株属于P.guilliermondii这个种。金属抗性试验表明,该菌株对重金属铜离子的抗性可高达45mmol/L,因此,它的分离为研究极端环境中微生物的抗铜机制提供了材料。