摘要:【背景】供试菌株分别是分离自山西省宁武县管涔山的肉色香蘑Lepista irina、斑褶香蘑L. panaeolus和山西省蒲县五鹿山的紫丁香蘑L. nuda 3种野生食用菌的子实体。【目的】获得3种野生食用菌的最佳培养条件。【方法】以菌丝生长速度为指标研究不同碳源、氮源、碳氮比、pH和培养温度等各因素对菌丝生长的影响，根据Box-Benhnken中心组合试验设计原理，采用3因素3水平的响应面法确定使菌丝体达到最快生长速度的最佳培养碳源、氮源和pH。【结果】肉色香蘑在葡萄糖20.9 g/L、土豆196.47 g/L、pH 6.0、培养温度21 °C的条件下，菌丝日均生长速度达到最大，为1.13 mm/d；斑褶香蘑在甘露醇17.4 g/L、酵母膏8.1 g/L、B族维生素0.1 g/L、K2HPO4 2.5 g/L、MgSO4 2.5 g/L、pH 7.9、培养温度25 °C的条件下，菌丝日均生长速度达到最大，为0.73 mm/d；紫丁香蘑在土豆200 g/L、可溶性淀粉20.5 g/L、KNO3 2.1 g/L、K2HPO4 2.5 g/L、MgSO4 2.5 g/L、B族维生素0.1 g/L、pH 7.0、培养温度25 °C的条件下，菌丝日均生长速度达到最大，为2.38 mm/d。【结论】获得了3种香蘑属菌株的最佳培养条件，为后续优质野生食用菌的引种驯化积累了相关数据和资源。

摘要:【背景】烟用香精是卷烟生产中的重要辅料，有些香精，特别是剩余的加料香精在运输和储存等过程中可能污染微生物，引起腐败变质发生。【目的】分析变质烟用香精中腐败微生物的群落多样性，确定引起加料香精变质的主要腐败微生物。【方法】采用稀释平板法，对我国典型湿热地区云南、福建和广西三地变质加料香精样品中的污染细菌、霉菌或酵母进行分离，分析其16S rRNA、ITS或26S rRNA基因序列，并通过反证试验确定引起变质的主要腐败微生物。【结果】所考察3个典型湿热地区变质加料香精存在不同程度的细菌、霉菌或酵母污染，其中细菌污染最为普遍。分离的76株污染细菌分布在2门4纲5目10科15属，细菌的群落多样性比较丰富，其中雷尔氏菌属(Ralstonia)、柠檬酸杆菌属(Citrobacter)、肠杆菌属(Enterobacter)及芽孢杆菌属(Bacillus)是优势菌群；9株霉菌分布在子囊菌门(Ascomycota)的3纲6属，每个属分离到1?2株霉菌；42株酵母分布在子囊菌门的6个属，其中毕赤酵母属(Pichia)、细枝钩酵母菌属(Wickerhamomyces)及酵母菌属(Saccharomyces)是优势菌群。云南和福建两地样品的细菌菌群组成明显多于广西，广西样品的霉菌菌群组成以及福建样品的酵母菌群组成均分别多于其余两地。反证试验结果显示，柠檬酸杆菌属、肠杆菌属、芽孢杆菌属、雷尔氏菌属和毕赤酵母属是引起烟用加料香精变质的主要腐败微生物。【结论】变质加料香精中污染微生物菌群组成及腐败微生物确定的研究将有助于我国湿热地区香精香料中污染微生物的控制和腐败变质的预防。

摘要:【背景】除了菌根真菌(Orchid mycorrhizal fungi，OrMF)外，兰科植物根中还有其它内生真菌，称为根相关真菌(Root-associated fungi，RAF)。【目的】采用分离培养的方法获得同一栖息地针叶林和灌木林两种不同生境西藏杓兰、黄花杓兰和无苞杓兰的RAF菌株，研究其真菌谱系、多样性和生态功能结构。【方法】从杓兰根碎屑中分离RAF，通过总DNA提取、PCR扩增及测序得到ITS (Internal transcribed spacer)序列；进行系统发育和多样性分析，并通过NCBI数据库比对得到相似性最高序列的注释信息来分析RAF生态学特性。【结果】共分离得到278株RAF，25种OTU类型，包括23个子囊菌门OTU，2个毛霉菌门OTU。RAF物种丰富度分析发现西藏杓兰的较黄花杓兰高，不同生境没有显著差异；不同杓兰物种较不同生境的RAF群落分化程度高。生态功能分析显示25个OTU包括共生型、腐生型和致病型3种营养型，以及外生菌根菌群、植物病原菌群、内生真菌群、动物病原菌群、真菌寄生菌群、杜鹃花类菌根群、未定义的腐生菌群和不确定型8种共位群。【结论】阐明不同生境采集的不同杓兰中RAF的分布特点和生态功能，为未来研究RAF与杓兰属植物的共生关系奠定基础。

摘要:【背景】不产氧光合细菌(Anoxygenic phototrophic bacteria，APB)作为一类重要的微生物资源，在水产养殖水体氮污染的修复方面已有广泛研究与应用。养殖水体环境复杂，含多种有机物，尤其是有机氮显著影响菌体除氮功效。【目的】在高浓度无机三态氮(氨氮、硝氮和亚硝氮)共存体系中，阐明小分子有机碳、有机氮和盐度对固氮红细菌(Rhodobacter azotoformans) YLK20去除无机三态氮的影响规律及机制，挖掘针对性强和适应性广的高效除氮菌株。【方法】采用RAST和KEGG方法分析YLK20基因组碳氮代谢途径及耐盐机制；采用次溴酸钠氧化法、紫外和N-(1-萘基)-乙二胺分光光度法分别测定氨氮、硝氮和亚硝氮含量。【结果】基因组显示，YLK20拥有EMP、HMP、TCA、固氮、氨化、氨同化和反硝化碳氮代谢途径，含有sohB、nhaC、betB和gbsA等多种耐盐基因。丙酮酸钠、乙酸钠、柠檬酸钠、乙醇和甘露醇是YLK20生长和去除无机三态氮的良好有机碳，葡萄糖和果糖的存在降低了无机三态氮去除能力，蔗糖体系中硝氮和亚硝氮能被良好去除，但氨氮去除能力较低。在高浓度蛋白胨(3.21 g/L)和尿素(1.43 g/L)体系中，YLK20仍能高效去除无机三态氮。YLK20能在3%盐度内生长良好，低盐度时该菌株能良好去除无机三态氮，高盐度时亚硝氮去除能力受到严重抑制。YLK20对海水和淡水实际养殖水体中的无机三态氮有良好去除效果。【结论】 YLK20主要通过氨同化和反硝化途径去除无机三态氮，尤其在高浓度有机氮环境中也能高效去除；该菌株适应盐度范围广，兼可适用于淡水和海水养殖水体；该菌株生长和无机三态氮去除影响因素、规律及除氮机制的阐明，可为APB微生物制剂的合理应用提供指导。

摘要:【背景】在地衣共生系统中除了共生真菌、藻类以外，还蕴藏着丰富的放线菌资源。【目的】采集来自云南西双版纳、白茫雪山、德国波罗的海南岸3个地区的地衣，对获得的地衣纯培养放线菌进行多样性分析。【方法】采用3种放线菌选择分离培养基，通过平板稀释涂布法分离放线菌。通过比较16S rRNA基因序列相似性以及构建系统发育树，确定纯培养放线菌的分类地位。【结果】共分离菌株1 123株，鉴定417株。其中从西双版纳17份地衣样品中分离纯化到107株放线菌，分布在7个目14个科33个属，潜在新种18株，其中链霉菌为优势菌属；从白茫雪山7份地衣样品中分离纯化到103株放线菌，分布在4个目5个科9个属，潜在新种16株。其中链霉菌为优势菌属，占比39%；从波罗的海南岸5份地衣样品中分离纯化到65株放线菌，分布在4个目8个科18个属，潜在新种5株，潜在新种菌和链霉菌为优势菌属。【结论】在本研究条件下，西双版纳可培养地衣放线菌多样性较白茫雪山和波罗的海南岸丰富。白茫雪山地衣链霉菌居多，潜在新种占比15.5%。3个地区地衣放线菌的区系组成各不相同，这与3个地区地衣所处地理环境、完全不同的气候密切相关。

摘要:【背景】异养硝化-好氧反硝化菌由于能够同时实现硝化反硝化作用而备受关注，但由于菌的种类不同，其脱氮途径不尽相同，研究菌株脱氮关键酶的种类及其活性可以推测菌株的脱氮途径，从而为菌株在生产上的应用提供技术支撑。【目的】研究Pseudomonas alcaliphila AD-28的脱氮性能及其关键酶的活性，为菌株脱氮分子机理研究奠定基础。【方法】以柠檬酸钠为碳源，以硫酸铵、亚硝酸钠、硝酸钾为氮源，研究菌株AD-28的脱氮性能并检测其关键酶氨单加氧酶(AMO)、羟胺氧化还原酶(HAO)、亚硝酸盐还原酶(NIR)、硝酸盐还原酶(NAR)的酶活性。【结果】菌株AD-28培养24 h的菌密度(OD600)可达1.971，对初始浓度为18.85 mg/L的氨氮、26.13 mg/L的硝酸盐氮、19.47 mg/L的亚硝酸盐氮、66.11 mg/L的总氮去除率均达到96%以上；关键酶AMO、HAO、NIR和NAR的比活力分别为0.028、0.003、0.011、0.027 U/mg。【结论】Pseudomonas alcaliphila AD-28能同时进行异养硝化-好养反硝化作用，该菌在AMO作用下将NH4+-N氧化为羟胺，然后由HAO氧化为NO2?-N，NO2?-N和NO3?-N在NIR、NAR等酶的催化作用下脱氮。

摘要:【背景】近年来，由于金属矿的开采和冶炼、砷产品的加工与使用、煤的燃烧等各种因素，导致土壤环境中的砷污染越来越严重，导致许多人暴露于极度危险的砷毒毒害之下。【目的】研究四川的万顺铅锌矿区蜈蚣草根组织内生细菌aoxB基因的多样性，为提高土壤重金属污染生态修复效率提供理论依据。【方法】利用实时荧光定量PCR (Real-time quantitative PCR，qPCR)和限制性片段长度多态性(Restriction fragment length polymorphism，RFLP)技术，对四川省汉源县万顺铅锌矿区蜈蚣草根组织内生细菌aoxB基因表达量及多样性进行研究。【结果】qPCR结果表明，不同采样点间的蜈蚣草根组织内生细菌aoxB基因表达量存在明显差异，表现为选矿区>进山口>弃渣场>尾矿区>矿口。酶切图谱结果表明，不同采样点蜈蚣草根组织内生细菌aoxB基因多样性存在明显差异，多样性指数表现为尾矿>矿口>弃渣场>进山口>选矿区。Pearson相关分析显示，aoxB基因的表达量与重金属As之间呈显著负相关(p<0.05)，多样性指数则与重金属Pb和As之间呈极显著正相关(p<0.01)。系统发育分析显示，aoxB基因的优势菌群为α-变形菌门(Alphaproteobacteria)。【结论】蜈蚣草根组织中存在丰富的含aoxB基因内生细菌种群，这些内生细菌表现出潜在的应用价值。

摘要:【背景】嗜盐微生物多生活于高盐环境，具有独特的生理代谢特征，是一类重要的极端环境微生物资源。【目的】为更好地认识我国陆相盐矿的嗜盐微生物多样性组成，更好地开发利用嗜盐微生物资源积累丰富的微生物菌种。【方法】对安徽定远盐矿盐芯样品进行嗜盐微生物的纯培养分离，并对所分离菌株进行基于16S rRNA基因的测序和序列相似性分析，并对所分离菌株进行物种多样性分析。在此基础上，对代表菌株进行菌落形态和耐盐度及酶活测定。【结果】通过纯培养共分离获得了嗜盐微生物264株，其中嗜盐古菌150株，占56.8%；嗜盐细菌114株，占43.2%。嗜盐古菌物种分别来自于Halorubrum、Halopenitus、Haloterrigena、Natrinema、Natronoarchaeum和Natronomonas等6个属；嗜盐细菌物种分别来自于Pseudomonas、Aliifodinibius、Halobacillus、Halomonas和Halospina等5个属。通过代表菌株的酶活平板检测，发现产胞外蛋白酶菌株1株，酯酶1株，淀粉酶2株；能液化明胶菌株2株。在物种多样性组成方面，发现嗜盐古菌的物种多样性指数高于嗜盐细菌。【结论】本研究对我国安徽定远陆相盐矿的可培养嗜盐微生物多样性进行探究，积累了丰富的嗜盐微生物菌株资源。

摘要:【背景】Ⅱ类羊毛硫细菌素大多是由革兰氏阳性菌的核糖体合成并经过翻译后修饰产生的小肽，其生物合成的最后一步是由转运蛋白LanT N端的肽酶结构域对前导肽进行切割，释放出有活性的羊毛硫细菌素，但目前关于该类羊毛硫细菌素前导肽的切割机制尚不清楚。【目的】考察前导肽切割位点对不同链球菌来源的肽酶结构域BovT150和SboT150酶切活性的影响。【方法】运用不依赖连接酶的定点突变技术构建前导肽切割位点突变的前体蛋白表达载体，在大肠杆菌(Escherichia coli)中分别表达纯化野生型前体(BovAm和SboAm)、突变型前体及对应的切割酶(BovT150和SboT150)，构建体外酶切体系，利用HPLC、抑菌活性分析和MALDI-TOF MS检测前导肽的切除情况。【结果】BovT150不仅能够切割BovAm的GG和GA位点，也能切割SboAm的GG和GA位点，并且对切割位点为Gly的前体切割活性较高；SboT150仅能切割SboAm的GG和GA位点，而对切割位点为Ala的活性较高。【结论】II类羊毛硫细菌素前导肽切割位点氨基酸残基的改变不同程度地影响切割酶的切割效率。

摘要:【背景】金孢属是一类重要的嗜角蛋白真菌资源。【目的】对我国甘肃省和云南省土壤中的金孢属资源进行调查。【方法】采集不同环境中的土壤样品，利用鸡毛和头发对土壤样品中的这类资源进行钓饵，分离目标菌株；基于形态特征和ITS rDNA序列进行系统发育分析相结合的方法进行菌株的鉴定。【结果】从土壤中分离发现5个金孢属菌株，其中菌株H5.11在形态上与节状金孢模式菌株的形态特征非常相近，而且系统发育中与GenBank上报道的该种序列以较高的支持率聚在一个亚分支；H10.10菌株的形态特征与乔治金孢模式标本的形态非常吻合，培养基上均呈现红色，同时系统发育分析结果表明该菌株与GenBank上报道的序列较好的聚在一个亚分支中；EB8803M和EB8801M两个菌株在形态特征上与水生金孢模式标本的描述非常吻合，系统发育分析结果显示它们与网上该种序列能较好地聚在一个亚分支中；O1菌株在形态特征上与轮带金孢模式标本的描述非常吻合，其系统发育表明它与GenBank已报道菌株序列能较好聚在一起。因此将它们鉴定为节状金孢Chrysosporium articulatum、乔治金孢C. georgiae、水生金孢C. submersum和轮带金孢C. zonatum。【结论】这4个种均为中国新记录种。

摘要:【背景】氨甲酰磷酸是生物合成代谢中精氨酸与嘧啶的重要前体物质，在工业微生物生产精氨酸与嘧啶及其衍生物中发挥关键作用。【目的】在大肠杆菌Escherichia coli BW25113中比较氨甲酰磷酸不同合成途径的催化效率。【方法】在大肠杆菌Escherichia coli BW25113中过表达鸟氨酸氨甲酰基转移酶(OTC)的基础上，分别过表达大肠杆菌自身的氨基甲酸激酶(CK)和氨甲酰磷酸合酶(CPS Ⅱ)并表征其反应效果。通过优化底物供应(调整底物浓度与引入L-谷氨酰胺合成酶)对CK与CPS Ⅱ的催化反应进行优化。【结果】在大肠杆菌中过表达OTC，建立细胞水平氨甲酰磷酸检测体系。在此基础上比较不同来源的CK，发现大肠杆菌来源的CK效果最好，50 mmol/L NH4HCO3条件下全细胞催化9 h得到2.95±0.15 mmol/L L-瓜氨酸；过表达CPS Ⅱ时，50 mmol/L L-谷氨酰胺催化9 h得到3.16±0.29 mmol/L L-瓜氨酸。通过改变底物NH4HCO3浓度和引入外源L-谷氨酰胺合成酶(GS)等方式对CK与CPS Ⅱ的催化反应分别进行优化后，100 mmol/L NH4HCO3条件下，L-瓜氨酸浓度分别提高至4.67±0.55 mmol/L和6.12±0.38 mmol/L，且过表达GS后CPS Ⅱ途径可以利用NH3，不需要额外添加L-谷氨酰胺。【结论】引入L-谷氨酰胺合成酶后的CPS Ⅱ途径合成氨甲酰磷酸的能力优于CK途径，为精氨酸、嘧啶及其衍生物的合成提供了一种更加高效的策略。

摘要:【背景】新疆绿洲生态系统的大规模农垦开发对当地生态环境产生了一系列影响，评估农业活动对新疆地区原始生态土壤细菌群落的影响对合理利用土地、开发农业资源具有指导意义。【目的】通过研究塔里木河中下游流域受农垦开发影响的棉田及未经历土地开垦的胡杨林土壤细菌群落结构及多样性的变化，探究农垦开发活动对土壤微生态的影响。【方法】利用国标法测定塔里木河中下游流域绿洲棉田及原始胡杨林全氮、总盐、有机质、碱解氮、有效磷、速效钾、pH等土壤理化性质；提取土壤总DNA，通过PCR扩增建立文库，用新一代Illumina Hiseq 2500测序技术对土样DNA进行16S rRNA基因(V4区)高通量测序；利用生物信息学分析细菌群落的α多样性(包括Chao1、observed species、phylogenetic diversity (PD)、Shannon、Simpson和Good’s coverage指数)、β多样性在两地的变化，基于线性判别分析流程[linear discriminant analysis (LDA) effect size pipeline，LEfSe]分析在两地具有显著差异的细菌分类单元；结合土壤理化参数、群落功能预测分析可能影响两地细菌群落结构变化的主要因子。【结果】土壤基本理化性质分析：绿洲棉田与原始胡杨林相比，全氮、碱解氮、总盐、pH含量显著增加，土壤盐含量与全氮、碱解氮和pH呈显著正相关(P<0.05)；细菌多样性分析：α多样性指数Chao1、observed species和PD在棉田样品中均显著低于胡杨林样品，Shannon指数差异虽不显著，但是也表现出同样的变化趋势；细菌群落组成分析：两组样品中的优势细菌依次为α-变形杆菌纲、放线菌门、芽单胞菌门、拟杆菌门、酸杆菌门、γ-变形菌纲、β-变形菌纲、δ-变形菌纲、绿弯菌门、厚壁菌门、浮霉菌门、泉古菌门和硝化螺旋菌门(丰度>1%)；差异分析的结果显示，新疆绿洲棉田土壤中显著富集的微生物主要包括酸杆菌门、放线菌门、绿弯菌门、厚壁菌门、黄杆菌纲、α-变形菌纲、γ-变形菌纲中的一些物种，以及泉古菌门中的Candidatus Nitrososphaera；新疆原始胡杨林土壤中显著富集的微生物主要包括绿菌门、δ-变形菌纲以及变形菌门中的其他物种, 还包括泉古菌门中的Nitrosopumilus。主坐标分析(PCoA)结果显示，棉田生态系统的土壤细菌群落结构能够与胡杨林生态系统的群落结构明显分开，且前者的细菌群落结构一致性更高。功能预测结果显示，绿洲棉田的硝化作用显著高于原始胡杨林。冗余分析(RDA)结果表明全氮含量对细菌群落结构有显著影响。【结论】在长期耕种施肥等人为因素干扰下，绿洲棉田土壤细菌多样性和群落结构发生明显改变，细菌α多样性明显低于原始胡杨林，细菌β多样性差异减弱，同时一些与植物生长密切相关的细菌类群，如放线菌、硝化细菌等显著富集。该研究可为新疆绿洲棉田生态系统的开发利用现状提供数据参考。

摘要:【背景】植物-微生物联合修复土壤重金属污染日渐兴起，获取与超富集植物高效互作的微生物是实现联合修复技术进步的关键。龙葵在镉农田污染修复中广泛应用。【目的】筛选可促进龙葵生长及富集镉的耐镉根际促生菌。【方法】从龙葵根际土分离耐镉菌株，筛选具有良好促生特性的菌株，水培试验考察镉胁迫下菌株对植物生长及镉富集能力的影响，确定可促进龙葵生长及富集镉的微生物菌株，通过生理生化特性和16S rRNA基因序列分析进行菌株的初步鉴定。【结果】分离得到NT1、AXY1、AW2和AW1四株强化龙葵富集镉促生菌，经鉴定分别为Lysinibacillus sp.、Beijerinckia fluminensis、Achromobacter animicus和Herbaspirillum huttiense。上述菌株均可有效促进龙葵生长，增加其株高和干物质积累，提高地上部镉富集量。其中，NT1可使株高、地上部干重分别增加31.33%和62.65%，AW2可使地上部镉富集量增加37.29%。【结论】筛选所得菌株可为提高植物修复效率提供实践依据，为研制田间施用生态功能菌剂做铺垫，用于农田镉污染的微生物-龙葵联合原位修复。

摘要:【背景】2018年7?8月，甘肃省兰州市永登县武胜驿镇种植的莴笋大面积发生炭疽病，约40%的地块发病，绝收面积达10%。【目的】明确莴笋炭疽病的病原。【方法】采用组织分离法进行病原菌分离；通过Koch’s法则明确分出病菌的致病性；采用形态学和分子生物学方法对病原菌进行种类鉴定。【结果】分离得到形态特征一致的真菌菌株3株。在PDA平板上20 °C培养7 d，病菌分生孢子无色，单隔，梭形，(10.44?19.40) μm×(2.61?4.48) μm。代表性菌株Lett-11 接种莴笋离体叶片可引起与自然发病相似的症状。BLASTn分析结果显示，菌株Lett-11 (GenBank登录号MK252097)的rDNA-ITS序列与莴苣盘二孢菌Marssonina panattoniana strain CBS 163.25 (GenBank登录号MH854831.1)的序列相似性达99%。【结论】引起莴笋炭疽病的病原菌被鉴定为莴苣盘二孢菌Mar. panattoniana [Synonymy: Microdochium panattonianum]，这是莴苣盘二孢菌引起莴笋炭疽病在甘肃的首次报道。

摘要:【背景】从黄酒发酵液中分离的短乳杆菌2-34具有重吸收瓜氨酸的能力，可用于降低黄酒中的瓜氨酸从而减少氨基甲酸乙酯的形成，然而瓜氨酸重吸收机制的不明确阻碍了该菌的合理利用。【目的】通过确定短乳杆菌2-34中的瓜氨酸转运蛋白编码基因，为其在黄酒中的利用提供理论依 据。【方法】以pRSFDuet-1和pETDuet-1为表达载体，通过多顺反子串联表达系统及双质粒表达系统，在大肠杆菌C43(DE3)中表达短乳杆菌2-34精氨酸脱亚胺途径中瓜氨酸代谢相关蛋白：精氨酸降解酶ArcD和ADI、瓜氨酸降解酶OTC及膜蛋白DcuC和AO antiporter。【结果】重组表达大肠杆菌发酵过程中可利用精氨酸形成瓜氨酸，但表达了膜蛋白DcuC和AO antiporter的重组菌发酵液中瓜氨酸含量较低。【结论】短乳杆菌2-34中DcuC和AO antiporter均具有吸收瓜氨酸的功能，且DcuC活性更高。

摘要:【背景】被广泛应用于食品和饲料等多个行业的乳酸菌已成为制作生物防腐剂的研究热点。【目的】探究抑菌性能良好的植物乳杆菌DY6的抑菌物质，为其进一步应用提供参考依据。【方法】对植物乳杆菌发酵液中抑菌物质的理化特性进行研究，采用GC-MS分析发酵上清液代谢物，通过多元统计学分析方法推测主要抑菌物质，抑菌物质通过半制备进行初步分离后用GC-MS鉴定。【结果】植物乳杆菌DY6对金黄色葡萄球菌、大肠杆菌、沙门氏菌都有较强的抑制作用。采用不同发酵时间的发酵液作为研究对象，测定发酵上清液的抑菌能力，发酵0?4 h上清液无抑菌能力，发酵至8 h抑菌能力逐步上升，发酵24?48 h发酵上清液抑菌能力趋于稳定，在48 h时抑菌能力最佳，抑菌直径为15.28 mm。通过多元统计学分析乳酸菌发酵液差异标志物，发现主要差异物为有机酸(如乳酸、乙酸、丙酸等)和脂肪酸(如辛酸、癸酸等)。经过半制备液相分离发酵上清液得到的抑菌组分，主要有有机酸(如乳酸、乙酸、3-苯基乳酸、苯丙酸等)和脂肪酸(如癸酸、辛酸、壬酸等)，另外还有少量的醛类和醇类物质。【结论】确定了植物乳杆菌DY6的抑菌物质主要为有机酸和脂肪酸，为其进一步防腐应用提供了理论基础。

摘要:【背景】米曲霉通过蛋白酶的作用将大分子蛋白质分解为蛋白胨、多肽及氨基酸等营养物质。豆瓣酱的一个重要指标氨基态氮含量则直接由蛋白酶决定，因此米曲霉在豆瓣酱发酵中有着至关重要的作用。【目的】筛选一种高产蛋白酶豆瓣酱专用菌株，研究其发酵豆瓣酱品质的改良效果。【方法】以自然发酵成曲为原料，筛选高产蛋白酶的霉菌。以筛选菌株为曲种发酵制曲，进一步发酵甜瓣子，测定制曲过程中霉菌增长速度和蛋白酶增长速度，通过发酵甜瓣子氨基态氮、挥发性风味物质等指标的测定分析菌株发酵甜瓣子品质的改进效果。【结果】筛选得到17株高产蛋白酶的霉菌，其中菌株PCSM002制曲生长速度最快，PCSM001和PCSM002号菌株产蛋白酶能力最强，麸皮培养基中培养3 d蛋白酶酶活分别为1 450.25、1 703.25 U/g。PCSM001和PCSM002发酵24 d甜瓣子氨基态氮含量达到0.86 μg/kg以上，且发酵的甜瓣子香气浓郁、口感丰富。两株菌均已送至广东省微生物菌株保藏中心保藏，保藏编号分别为GDMCC 60198和GDMCC 60199。【结论】筛选得到的高产蛋白酶霉菌有望用于豆瓣酱的发酵，作为豆瓣酱发酵专用菌株，以提高豆瓣酱品质。

摘要:【背景】在食品安全领域，克罗诺杆菌属于需要重点监测的致病菌，当前随着分子检测相关技术的不断发展，研制有关食品中克罗诺杆菌简便、高效的检测产品至关重要。【目的】研制克罗诺杆菌检测的双重PCR检测试剂盒并评价其用于食品中克罗诺杆菌检测的实效性。【方法】优化双重PCR反应体系，反应试剂采用冻干工艺，确立了试剂盒组成，并评价其特异性、灵敏度、重复性、保质期等性能指标。【结果】克罗诺杆菌标准菌株和分离菌株均在目标位置出现两条明显条带，非克罗诺杆菌标准菌株和分离菌株均检测为阴性，纯基因组DNA检测灵敏度为2.3×10?1 ng/μL，纯培养菌检验限为3.2×104 CFU/mL；对65份食品样品进行克罗诺杆菌检测，该试剂盒检测结果与标准方法检测结果一致性较高；批内、批间检测重复率均为100%，可在42 °C环境放置120 h且其检测效力不受影响，4 °C保质期可长达12个月。【结论】该试剂盒性能好，检测结果稳定、可靠，适用于食品中克罗诺杆菌的快速检测。

摘要:【背景】脂肪酶是一类特殊的酯键水解酶，广泛应用于工业化生产中，微生物是工业脂肪酶的主要来源。瘤胃中微生物种类繁多、数量庞大，已有关于瘤胃微生物产纤维素酶的报道，尚无产脂肪酶瘤胃微生物的分离筛选报道。【目的】从牦牛瘤胃中分离筛选出能够产脂肪酶的微生物，并进行菌株鉴定及其酶学性质的研究。【方法】以橄榄油为唯一碳源，通过中性红油脂平板进行初步筛选后，用改进铜皂-分光光度法测定酶活力进行复筛；再经形态学观察、生理生化实验和16S rRNA基因序列分析进行菌种鉴定；研究3种脂肪酶的最适作用温度、pH值及金属离子、有机溶剂和表面活性剂对酶活力的影响。【结果】筛选出6株酶活力较高的菌株，其中3株为液化沙雷氏菌，2株为白地霉，1株为卷枝毛霉。脂肪酶的酶学性质研究表明：液化沙雷氏菌、白地霉和卷枝毛霉所产脂肪酶的最适作用温度为45、35和40 °C；最适pH为8.0、7.0和7.0；Ca2+和Mg2+对3种脂肪酶均有激活作用；Zn2+对3种脂肪酶有不同程度的抑制作用，EDTA、SDS可使3种脂肪酶失活；3种脂肪酶对丙三醇的耐受力较高，卷枝毛霉脂肪酶对甲醇、乙醇、丙酮的耐受力较高。【结论】从牦牛瘤胃中分离出3种产脂肪酶的微生物，且证实瘤胃微生物在脂肪酶研究方面具有较高的价值。

摘要:【背景】链霉菌属于放线菌科，在土壤环境中广泛分布。链霉菌具有复杂的形态分化和多样性的次生代谢网络，能产生大量具有生物活性的次级代谢产物，被广泛深入研究。【目的】天蓝色链霉菌是链霉菌的模式菌株，其脂肪酸合成代谢与次级代谢联系紧密，但目前脂肪酸合成代谢途径还不清楚，其长链3-酮脂酰ACP合成酶还未见报道。【方法】利用大肠杆菌FabF序列进行同源比对，发现天蓝色链霉菌A3(2)的基因组中，SCO2390 (ScoFabF1)、SCO1266 (ScoFabF2)、SCO0548 (ScoFabF3)和SCO5886 (ScoRedR)具有较高的相似性，并具有保守的Cys-His-His催化活性中心，可能具有长链3-酮脂酰ACP合成酶活性。采用PCR扩增方法分别获得以上基因，连入表达载体pBAD24M后分别互补大肠杆菌fabB(ts)突变株和fabB(ts)fabF双突变株，并检测转化子的生长情况。以上基因与pET-28b连接后，在大肠杆菌BL21(DE3)中表达，并利用Ni-NTA纯化获得蛋白，体外测定其催化活性。将以上基因分别互补大肠杆菌fabF突变株后，GC-MS测定互补株的脂肪酸组成。【结果】4个同源基因中，只有ScofabF1能恢复fabB(ts)fabF双突变株42 °C时在添加油酸条件下的生长，其他3个基因均不能恢复生长。而这4个基因都不能恢复fabB(ts)突变株42 °C时生长。体外活性测定ScoFabF1具有长链3-酮脂酰ACP合成酶活性，其他3个蛋白都不具有该活性。仅ScofabF1能显著提高大肠杆菌fabF突变株的顺-11-十八碳烯酸(C18:1)比例，其他3个基因都不具有该功能。【结论】天蓝色链霉菌中ScofabF1编码长链3-酮脂酰ACP合成酶II，在脂肪酸利用过程中发挥重要作用。天蓝色链霉菌中没有发现编码长链3-酮脂酰ACP合成酶I的基因，其可能通过其他途径合成少量的不饱和脂肪酸。以上研究结果为进一步研究天蓝色链霉菌中脂肪酸合成机制奠定了基础。

摘要:【背景】纳他霉素(Natamycin)是一种天然、广谱、高效的多烯大环内酯类抗真菌剂，褐黄孢链霉菌(Streptomyces gilvosporeus)是一种重要的纳他霉素产生菌。目前S. gilvosporeus基因组序列分析还未有报道，限制了该菌中纳他霉素及其他次级代谢产物合成及调控的研究。【目的】解析纳他霉素高产菌株S. gilvosporeus F607的基因组序列信息，挖掘其次级代谢产物基因资源，为深入研究该菌株的纳他霉素高产机理及生物合成调控机制奠定基础。【方法】利用相关软件对F607菌株的基因组序列进行基因预测、功能注释、进化分析和共线性分析，并预测次级代谢产物合成基因簇；对纳他霉素生物合成基因簇进行注释分析，比较分析不同菌种中纳他霉素生物合成基因簇的差异；分析预测S. gilvosporeus F607中纳他霉素生物合成途径。【结果】F607菌株基因组总长度为8 482 298 bp，(G+C)mol%为70.95%，分别在COG、GO、KEGG数据库提取到5 062、4 428、5 063个基因的注释信息。同时，antiSMASH软件预测得到29个次级代谢产物合成基因簇，其中纳他霉素基因簇与S. natalensis、S. chattanoogensis等菌株的纳他霉素基因簇相似性分别为81%和77%。除2个参与调控的sngT和sgnH基因和9个未知功能的orf基因有差异外，S. gilvosporeus F607基因簇中其他纳他霉素生物合成基因及其排列顺序与已知的纳他霉素基因簇高度一致。【结论】分析了S. gilvosporeus全基因组信息，预测了S. gilvosporeus F607中纳他霉素生物合成的途径，为从基因组层面上解析S. gilvosporeus F607菌株高产纳他霉素的内在原因提供了基础数据，为揭示纳他霉素高产的机理及工业化生产和未来新药的发现奠定了良好的基础。

摘要:【背景】微生物转化是对天然产物进行结构修饰的重要手段，具有催化反应快、选择性强、反应条件易控制和污染小等特点。许多微生物能够对蟾毒配基类化合物进行生物转化，在不同位置进行结构修饰，并且产生毒性减弱的活性衍生物。【目的】筛选蟾毒灵生物转化菌株，以期发现活性更好、毒性降低的化合物。【方法】利用蟾毒灵为底物筛选其生物转化菌株，通过HPLC (High performance liquid chromatography)/LC-MS (Liquid chromatograph-mass spectrometer)鉴定转化产物；对可生物转化蟾毒灵的菌株进行菌落形态观察和分子生物学鉴定，并优化发酵条件提高转化率，同时测试该菌株对其他甾体化合物的转化作用。【结果】筛选获得一株蟾毒灵转化菌，经形态学与ITS (Internal transcribed spacer)分析鉴定为Naganishia属菌，转化产物为3-去氢蟾毒灵。该菌株生物转化的培养基最适底物浓度为8 mg/L，最适初始pH值为6.5，最佳接种量为3%，最佳转化时间为96 h，最终转化率为48.3%。该菌株可将雌酮E1转化为雌二醇E2，也可将雌二醇E2逆向转化为E1。【结论】首次发现Naganishia属菌株对甾体类化合物具有转化活性，其产生的弱细胞毒性的转化产物3-去氢蟾毒灵有望成为高效、安全的强心药物。微生物转化法选择性高、反应条件温和、操作简单，为大量制备活性化合物3-去氢蟾毒灵提供了一条简便易行的道路，也为更多甾体化合物结构修饰提供了可能。

摘要:【背景】随着载人飞行时间的延长，微生物安全问题越来越凸显。载人航天疾病谱显示感染性疾病是航天员在轨常发的疾病之一，影响航天员健康。大肠杆菌是人体肠道存在的正常菌群，也是条件性致病菌，可引起感染性疾病，因此有必要分析研究太空环境对大肠杆菌代谢的影响。【目的】通过“实践十号”返回式科学实验卫星搭载大肠杆菌近地轨道飞行12 d后，分析鉴定大肠杆菌在太空环境下代谢水平的变化。【方法】应用非靶向代谢组学技术对卫星搭载的大肠杆菌K12及地面同种对照组进行质谱分析，通过主成分分析(PCA分析)和正交偏最小二乘判别分析(OPLS-DA分析)找出组间潜在的差异生物标志物。【结果】通过分析鉴定，共发现12种显著差异生物标志物，其中搭载组11种参与能量代谢和甘油磷脂代谢的生物标志物含量上调，1种脂肪酸含量下调。【结论】太空飞行可提高大肠杆菌能量代谢与甘油磷脂代谢水平，相关代谢产物的变化提示太空飞行可能会促进大肠杆菌增殖。

摘要:【背景】乳杆菌对众多致癌物具有吸附作用，但关于乳杆菌结合吸附苯并芘特性的研究并不多。【目的】探讨戊糖乳杆菌(Lactobacillus pentosus) ML32和植物乳杆菌(Lactobacillus plantarum) 121对加工肉制品中苯并芘的吸附能力与吸附机制。【方法】基于HPLC检测菌体对不同模拟加工处理方式肉品中的苯并芘的吸附率。【结果】植物乳杆菌121和戊糖乳杆菌ML32对模拟油炸、烟熏或烧烤方式处理肉中苯并芘的吸附率均在30%以上。菌株121对直接烟熏肉中的苯并芘吸附率为41.21%，直接油炸肉中吸附率为38.71%，直接烧烤肉中吸附率为37.51%；菌株ML32对间接烟熏肉中的苯并芘吸附率为40.02%，间接烧烤肉中吸附率为38.01%。植物乳杆菌121适合于去除高温长时间加工肉中的苯并芘，戊糖乳杆菌ML32则相反。另外，乳杆菌细胞壁中的肽聚糖或许在吸附过程中发挥了主要作用。【结论】两株乳杆菌121和ML32具有吸附某些加工肉制品中苯并芘的效果，或许可以作为一种方法用于消除某些肉制品中因苯并芘过量带来的风险。

摘要:【背景】菌种保藏方法与保藏效果是菌种质量的前提和保证。随着真姬菇Hypsizygus marmoreus栽培规模和产量的逐年递增，选择最佳的菌种保藏方法也越来越迫切。【目的】对真姬菇菌种的常见保藏方法及保藏效果进行分析和研究，寻找简便、高效、廉价的真姬菇菌种保藏方法。【方法】通过对比菌丝生长率、菌丝脱氢酶活性以及菌丝对色度培养基的脱色率等指标参数来评价保藏方法的保藏效果。【结果】通过对三大类27种真姬菇菌种保藏方法3个月保藏效果的对比分析发现，三大类菌种保藏方法中保藏效果最好的是水溶液保藏法，其中以0.1% PEG6000水溶液保藏效果最佳；其次为木屑保藏法，其中以盐水浸泡过的杨木木屑保藏效果最好；斜面保藏法效果最差。正常保藏实验的效果好于加速保藏实验。【结论】与当前真姬菇菌种保藏的常规方法相对比，本实验所采用的菌种保藏方法大大拓宽了菌种保藏方法的种类与范围，提高了菌种保藏的效果。

摘要:环二腺苷酸(Cyclic diadenosine monophosphate，c-di-AMP)是细菌中广泛存在的第二信号分子。c-di-AMP在细菌中的代谢受二腺苷酸环化酶(Diadenylate cyclase，DAC)和磷酸二酯酶(Phosphodiesterase，PDE)的精密调控。c-di-AMP不仅调节细菌生长、细胞壁稳态、离子转运等多种生理过程，而且能够被真核宿主胞内多种感应子/受体蛋白识别，从而调控抗感染免疫。细菌c-di-AMP参与调控宿主I型干扰素应答、NF-κB信号通路活性、自噬以及炎症小体应答等固有免疫应答。此外，c-di-AMP作为黏膜佐剂可诱导宿主适应性免疫。c-di-AMP被认为是一种新发现的病原体相关的分子模式(Pathogen associated molecular pattern，PAMP)，已成为细菌疫苗和药物研究中的新靶点。

摘要:污水生物处理由微生物生理过程驱动，宏组学方法能够获得不同水平的分子信息，为认识污水处理系统中的微生物提供了新途径。本文对宏基因组学、宏转录组学、宏蛋白质组学与代谢组学等宏组学方法的发展进行综述，着重介绍各组学及整合宏组学在污水处理系统中的研究现状，并指出其应用前景。

摘要:胃肠道菌群对动物健康和生产性能起到重要作用。将益生菌应用于畜禽养殖可调节肠道微生态平衡，调控脂肪代谢，提高饲料利用率以及促进风味物质形成等多种途径提高畜禽肉的品质。本文综述了不同益生菌调节胃肠道微生态的机理，并通过改善肠道菌群结构来改善畜禽肉的品质，为进一步研究开发以胃肠道菌群为靶点的益生菌饲料提供参考。

摘要:肠道菌群作为分布在人体肠道内的微生物菌群，对发挥肠道正常生理功能起到了至关重要的作用。临床研究表明，大量使用广谱性抗菌药物会打破肠道菌群的平衡，导致抗生素相关性腹泻(Antibiotic-associated diarrhea，AAD)。然而，不同的肠道菌群与AAD的关系不尽相同。本文分别从致病菌导致AAD的机制、益生菌预防和治疗AAD的原理，以及条件致病菌与AAD的关系等方面进行综述，旨在为肠道菌群与AAD的研究提供理论依据，同时为临床上更精准地预防、诊断和治疗AAD提供参考。

摘要:粘细菌(Myxobacteria)隶属于δ变形菌纲(Deltaproteobacteria)的粘球菌目(Myxococcales)，是一类革兰氏阴性杆状细菌。它是继放线菌和真菌之后又一重要的活性次级代谢产物产生菌，尽管如此，由于分离纯化困难，粘细菌的研究进展一直较为缓慢。随着测序技术的进步和生物信息学的应用，大量粘细菌基因组被完成测序和报道。本文对粘细菌研究意义及该类资源开发价值、分离培养存在的困难进行了阐述，对粘细菌基因组注释及目前已测菌株的全基因组进行了归纳总结，同时介绍了基因组学在粘细菌生态、捕食机制、子实体形成以及次级代谢产物合成方面的研究进展。本文有助于了解基因组学在粘细菌研究中的重要价值，为联合应用多组学技术深入研究粘细菌代谢机制和社会性行为提供了参考，对粘细菌基础研究、资源发掘和开发利用具有重要意义。

摘要:近几年，肠道菌群与精神疾病，如孤独症谱系障碍、焦虑症、抑郁症等之间的关系越来越受到重视。本文主要介绍了肠道菌群调控精神行为的现有证据，并总结了益生菌对抑郁症干预作用的现有主要临床前及临床研究结果。虽然目前在这一领域取得了许多令人激动的进展，但仍需要更多深入的研究来促进我们理解肠道菌群与抑郁症二者之间的因果关联，并充分评估益生菌防治抑郁症的潜力。

摘要:天然产物及其衍生物，包括基于天然产物药效基团结构设计的化合物，约占临床药物的50%以上。几个世纪以来，真菌天然产物的药用价值闻名于世。无论从市场前景还是人道主义角度，真菌来源的小分子药物都具有极高的应用价值。本篇综述总结了真菌天然产物在临床上的应用，并以他汀类药物的研发历程揭示了真菌来源小分子是化学合成药物研发的重要灵感源泉。本篇综述涵盖了真菌来源的药物小分子，包括天然药物、相关衍生物以及结构修饰药物。

摘要:邻苯二酚是芳香族化合物多条生物降解途径中共有的一种重要的中间产物，根据开环方式的不同，可分为邻位降解途径和间位降解途径，其中邻位降解途径中的关键酶是邻苯二酚1,2-双加氧酶。本文主要综述了邻苯二酚1,2-双加氧酶的结构、酶学性质，以及它在芳香烃降解菌中存在的同工酶现象及其功能研究进展。

摘要:近年来翻转课堂作为以学生为主体、教师为主导的教学方式逐渐被应用于大学本科教学。本文以目前医学微生物学实验教学中存在的问题为着眼点，介绍了本校以基于微课的翻转课堂进行医学微生物实验教学改革的基本方式和实施效果。相对于传统教学模式，教改后的新型教学模式能够切实提高教学质量，也为本校其他医学基础实验课教学改革提供了有益的经验。

摘要:微生物技术在现代农业的生态、绿色发展中扮演着重要的作用。在分析了农业转型升级对高技术技能型农业人才的需求之后，课程组在教学实践中根据校企合作单位反馈，对微生物技术课程内容进行了优化。落实课程立德树人的目标，按照素能共育的教育理念，遵循理实一体、线上线下混合的教学模式，探索课程改革，更好地提升农业专业学生的专业技能与职业素养，服务现代农业。