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微生物学通报

  • 2014年第41卷第5期文章目次
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    • 41(5)封面

      2014, 41(5).

      摘要 (1183) HTML (0) PDF 244.22 K (1054) 评论 (0) 收藏

      摘要:

    • 41(5)目录

      2014, 41(5).

      摘要 (1039) HTML (0) PDF 250.04 K (1638) 评论 (0) 收藏

      摘要:

    • >工业微生物学
    • 来源于瘤胃菌Ruminococcus sp.的D-阿洛酮糖3-差向异构酶的底物结合位点分析

      2014, 41(5):811-817. DOI: 10.13344/j.microbiol.china.130368

      摘要 (1861) HTML (0) PDF 1.58 M (2435) 评论 (0) 收藏

      摘要:【目的】研究来源于瘤胃菌Ruminococcus sp.的D-阿洛酮糖3-差向异构酶的底物结合机制。【方法】通过同源模拟和同源序列比对,筛选与其底物结合相关的关键位点,进而通过定点突变构建突变体并对其动力学性质进行研究。【结果】筛选得到关键位点Y6和A109,构建了突变体Y6F、Y6I、A109P及A109L。【结论】Y6既与底物结合又与催化能力相关,其?OH只与底物结合相关,芳香环则与催化能力和结合能力均相关;而A109则只是底物结合的位点。该研究结果为D-阿洛酮糖3-差向异构酶的催化机理研究及分子改造提供了借鉴。

    • 一株节杆菌发酵产物中类胡萝卜素的分离及组分分析的初探

      2014, 41(5):818-823. DOI: 10.13344/j.microbiol.china.130365

      摘要 (1640) HTML (0) PDF 625.94 K (2516) 评论 (0) 收藏

      摘要:【目的】对实验室保存的一株红色球菌进行菌株鉴定,并对色素提取液的组分进行定性分析。【方法】采取形态学观察、16S rDNA序列同源性分析和生理生化分析相结合的方法确定菌株的分类地位。使用乙醇-丙酮混合液提取胞内色素,采用硅胶G薄板层析法对色素提取液进行初步分离纯化,并结合其光谱吸收特性、质谱结果进行定性分析。【结果】实验结果表明此菌株属于节杆菌属(Arthrobacter sp.)。薄板层析结果显示该菌株内主要有4种色素组分,且靠近溶剂前沿组分为黄色,其它组分皆为橘红色。吸收光谱特性、质谱结果显示黄色组分可能为β-胡萝卜素,橘红色组分可能为螺菌黄质系类胡萝卜素。【结论】此株节杆菌以较为廉价的糖蜜和玉米浆作为营养物质用于满足自身生长需要,并且积累胞内类胡萝卜素,因此该菌的进一步研究有一定的价值。

    • >海洋微生物学
    • 以亚硝氮为唯一氮源生长的海洋紫色硫细菌去除无机三态氮

      2014, 41(5):824-831. DOI: 10.13344/j.microbiol.china.130438

      摘要 (1802) HTML (0) PDF 459.11 K (2074) 评论 (0) 收藏

      摘要:【目的】揭示以亚硝氮为唯一氮源生长的海洋紫色硫细菌去除水体中无机三态氮的特征和规律。【方法】在光照厌氧环境下,以乙酸盐为唯一有机物,在分别以氨氮、亚硝态氮、硝态氮为唯一氮源和三氮共存的模拟水体中,采用Nessler’s试剂分光光度法、N-(1-萘基)-乙二胺分光光度法和紫外分光光度法分别测定水体中氨氮、亚硝态氮和硝态氮的含量,比浊法测定菌体生物量。【结果】随着时间的延长,海洋紫色硫细菌Marichromatium gracile YL28分别在氨氮、亚硝态氮和硝态氮为唯一氮源的水体中对三氮的去除量增加,生物量增大,水体pH升高,并逐渐趋于平衡;YL28对氨氮的最大去除量和最大耐受浓度分别为9.64 mmol/L和36.64 mmol/L,当氨氮浓度低于3.21 mmol/L时,去除率可达97.61%以上;与氨氮相比,以亚硝态氮和硝态氮为唯一氮源,菌体的生长速率、生物量和水体最终pH较低,但对亚硝态氮和硝态氮的去除速率和去除量仍然很高,当亚硝态氮和硝态氮浓度分别达13.50 mmol/L和22.90 mmol/L时,YL28仍能够完全去除。在三氮共存的水体中,YL28也能良好的去除无机三态氮,对亚硝态氮和硝态氮去除能力更强。【结论】在模拟水体中,海洋紫色硫细菌YL28能够分别以氨氮、亚硝态氮和硝态氮为唯一氮源生长,具有良好的耐受和去除无机三态氮的能力,尤其对亚硝态氮具有良好的去除能力。本研究为进一步开发高效脱氮,尤其是去除亚硝态氮的不产氧光合细菌水质调节剂奠定了基础,也为微生物制剂的合理应用提供参考。

    • 一株海洋低温葡萄糖氧化酶菌株的筛选、鉴定及部分酶学性质

      2014, 41(5):832-838. DOI: 10.13344/j.microbiol.china.130773

      摘要 (1657) HTML (0) PDF 1.22 M (2251) 评论 (0) 收藏

      摘要:【目的】从海洋样品中分离筛选出产葡萄糖氧化酶菌株。【方法】采用双层平板筛选法进行初筛、复筛确定一株酶活较好的菌株,命名为GOD2 (Glucose oxidase)。通过形态学、生理生化特征及16S rRNA基因序列分析研究其分类地位,并对其产生的葡萄糖氧化酶进行分离纯化和部分酶学性质的研究。【结果】细菌GOD2为产葡萄糖氧化酶菌株且遗传稳定,初步鉴定该菌株为假单胞杆菌(Pseudomonas migulae),其所产酶最适反应温度为20 °C,热稳定性较差,40 °C剩余相对酶活80%;超过40 °C酶活力迅速下降。【结论】GOD2是一株极具研究价值的产低温葡萄糖氧化酶菌株。目前没有关于利用该菌生产葡萄糖氧化酶的报道。

    • >环境微生物学
    • 工业废水中阿特拉津降解细菌的遗传和生理多样性

      2014, 41(5):839-848. DOI: 10.13344/j.microbiol.china.130372

      摘要 (1638) HTML (0) PDF 550.98 K (2429) 评论 (0) 收藏

      摘要:【目的】通过遗传学和生理学实验,揭示分离自工业废水的阿特拉津降解细菌具有遗传和生理多样性,为阐明阿特拉津生物降解的分子机理和阿特拉津降解细菌在污染环境生物修复中的应用提供新见解。【方法】用普通PCR方法检测菌株的阿特拉津降解基因,分析其降解基因组成;用基因组重复序列PCR技术(rep-PCR)分析降解菌株的基因组类型;用Western blot方法检测菌株阿特拉津降解途径的第一个酶三嗪水解酶(TrzN);用不同氮源(阿特拉津、莠灭净、扑草净、西玛津、氰草净、阿特拉通和氰尿酸)和碳源(蔗糖、葡萄糖、麦芽糖、乳糖、柠檬酸钠、乙酸钠和琥珀酸钠)培养降解菌株,通过检测培养液的OD600值,证明菌株能够利用的氮源和碳源种类。【结果】对分离自工业废水的27个阿特拉津降解菌株所进行的阿特拉津降解基因PCR检测表明,其降解基因组成分别为trzN-atzBC、trzN-atzABC和atzADEF;通过rep-PCR实验将27个阿特拉津降解菌株分为7个群;Western blot结果表明,27个菌株中有24个含有三嗪水解酶TrzN;氮源利用实验表明,2个菌株能够利用所有7种氮源生长,其余25个菌株只能利用其中的2?6种;碳源利用实验表明,10个菌株能够利用所有7种碳源生长,其余17个菌株只能利用其中的3?6种。【结论】分离自某工业废水的27株阿特拉津降解功能菌存在相当广泛的遗传和生理学上的多样性,trzN-atzABC降解基因组成为首次发现。

    • >基因克隆及功能研究
    • 里氏木霉分泌型表达载体的构建及绿色荧光蛋白的表达

      2014, 41(5):849-856. DOI: 10.13344/j.microbiol.china.130414

      摘要 (1526) HTML (0) PDF 1.62 M (2788) 评论 (0) 收藏

      摘要:【目的】构建里氏木霉分泌型表达载体,通过表达绿色荧光蛋白论证载体的可行性并初步观察绿色荧光蛋白在里氏木霉中的分泌过程。【方法】应用PCR及分子克隆技术将里氏木霉(Trichoderma reesei)纤维二糖水解酶(CBH1)的启动子及CBH1自身信号肽、终止子和潮霉素筛选基因依次插入骨架质粒pUC19中,构建出T. reesei表达载体Ppth15。将增强型绿色荧光蛋白(eGFP)基因装载入Ppth15中,获得eGFP表达载体Ppth15-eGFP。再将Ppth15-eGFP转化进T. reesei原生质体,通过潮霉素抗性筛选、基因组PCR检测等方法鉴定,获得阳性重组转化子。【结果】用PDA培养基培养阳性转化子2?3 d后,可在菌丝顶端、隔膜及培养基中清晰地观察到大量绿色荧光。【结论】表达载体构建成功且能够用于eGFP的表达,实验为进一步研究T. reesei表达其他基因提供了有效工具,同时为T. reesei胞外蛋白分泌的研究提供了参考。

    • >农业微生物学
    • 地衣内生菌Elaphocordyceps sp.的代谢产物

      2014, 41(5):857-861. DOI: 10.13344/j.microbiol.china.130715

      摘要 (2559) HTML (0) PDF 360.73 K (2387) 评论 (0) 收藏

      摘要:【目的】通过对猫耳衣内生菌Elaphocordyceps sp.代谢产物的研究,以期获得结构新颖、抗菌活性强的化合物。【方法】采用PCR扩增和测定nrDNA的ITS (Internal transcribed spacer)序列,在GenBank数据库中比对,并采用构建系统发育树的方法,确定该菌株的分类地位。采用硅胶柱色谱、凝胶柱色谱和高效液相色谱方法进行成分分离。根据理化性质和波谱数据进行结构鉴定。采用倍比稀释法进行抑菌活性测定。【结果】鉴定出供试菌株为地衣内生菌Elaphocordyceps sp.。从Elaphocordyceps sp.的发酵液中分离得到3个化合物,结构鉴定为麦角甾醇、4,8-Dihydroxy-1-tetralone和De-O-methyldiaporthin。化合物1–3表现弱的抑制白色念珠菌活性。化合物3具有非常强的植物毒活性(叶片敏感度:4 nmol)。化合物3在地衣内生菌Elaphocordyceps sp.发酵液中的得率为0.75 mg/L (3.2′103 nmol),远远高于其对叶片敏感度4 nmol。【结论】由猫耳衣内生菌Elaphocordyceps sp.产生的De-O-methyldiaporthin可作为一种微生物源除草剂。

    • 柑橘黄龙病寄主长春花内生细菌的分离及功能鉴定

      2014, 41(5):862-870. DOI: 10.13344/j.microbiol.china.130377

      摘要 (1950) HTML (0) PDF 551.28 K (2167) 评论 (0) 收藏

      摘要:【目的】感柑橘黄龙病长春花植株与健康长春花植株不同部位内生细菌菌群结构及功能对柑橘黄龙病菌与长春花内生细菌的相关性研究提供理论基础。【方法】利用兼性厌氧可培养技术以及植物内生菌功能特性分析相结合的方法。【结果】分别从感病和健康长春花叶、茎、根的组织中分离获得67株内生细菌,与GenBank中29种细菌的相似性达到 97%?100%。其中短小杆菌属(Curtobacterium sp.)、欧文氏菌属( Erwinia sp.)、蜡样芽胞杆菌(Bacillus cereus)为感病长春花内生细菌的优势菌群,鞘胺醇单胞菌属( Brevundimonas sp.)、芽胞杆菌属(Bacillus sp.)为健康长春花内生细菌的优势菌群;马胃葡萄球菌(Staphylococcus equorum)为两者的共同优势菌群。29种内生细菌进行功能分析,其中6株内生细菌至少具有4种功能特性,分属于马胃葡萄球菌、苏云金芽孢杆菌、巨大芽孢杆菌、短小杆菌属、摩氏摩根菌(Morganella morganii)及溶杆菌属(Lysobacter sp.) 5个属。【结论】感病与健康长春花植株中均含有丰富的内生细菌且差异较大,黄龙病菌的存在改变了长春花原有内生细菌的菌群结构。通过分析菌群的差异,有望找到与柑橘黄龙病菌生长相关的菌种。

    • >食品微生物学
    • 分离自马奶及其制品中7株乳酸菌的安全性初步评价

      2014, 41(5):871-880. DOI: 10.13344/j.microbiol.china.130830

      摘要 (1530) HTML (0) PDF 1.31 M (1815) 评论 (0) 收藏

      摘要:【目的】通过小鼠的急性毒性、30 d喂养及细菌移位试验,对马奶及其制品(酸马奶)中分离出来的7株肠球菌属乳酸菌进行初步安全性评价。【方法】分别对小鼠连续7 d及30 d灌胃不同剂量的肠球菌JHZ9、JHZ15、JHZ17、JHZ22、JHZ25、JHZ28、JNN1,对其一般体征进行观察,记录体重和食物摄入量,最后进行大体解剖,观察肝、肾、脾、心、肺并称重,同时进行细菌移位试验。【结果】除30 d喂养中,试验菌株JHZ17的高剂量组与生理盐水组差异显著(P<0.05),7 d急性毒性试验及30 d喂养试验中各试验组小鼠体重、食物摄入量与对照组相比无显著性差异(P>0.05),30 d喂养后小鼠各脏器(心、肝、脾、肺、肾)指标与对照组无显著性差异(P>0.05),小鼠的经口急性毒性最大耐受剂量(MTD)大于1010 CFU/(mL bw) 20 ml/(kg·d),属无毒级别,未发现细菌移位现象。【结论】肠球菌JHZ9、JHZ15、JHZ17、JHZ22、JHZ25、JHZ28、JNN1安全,无毒副作用。

    • >微生物育种
    • 原生质体紫外诱变选育可利用廉价碳源的高产油新菌株

      2014, 41(5):881-890. DOI: 10.13344/j.microbiol.china.130182

      摘要 (1449) HTML (0) PDF 8.27 M (2463) 评论 (0) 收藏

      摘要:【目的】研究并建立利用原生质体紫外诱变技术选育可利用廉价碳源发酵的高产油新菌株的方法。【方法】采用1.5%蜗牛酶和1.0%纤维素酶混合液水解去除细胞壁得到2A00015 (近平滑假丝酵母,Candida parapsilosis)的原生质体,将其放于紫外灯下诱变及再生壁培养,筛选获得可利用廉价碳源发酵的高产油酵母,并采用气相色谱质谱联用法(GC-MS)测定其脂肪酸组成。【结果】突变效果最好的突变菌株2A00015/25用葡萄糖发酵培养7 d后,其生物量、油脂产率和产油量分别为17.77 g/L、58.12%和10.32 g/L,较原始菌株分别提高了12.45%、23.32%和38.68%;利用废糖蜜发酵培养,其生物量、油脂产率和产油量分别为18.54 g/L、49.44%和9.17 g/L,较原始菌株分别提高了9.09%、21.16%和32.18%。利用废糖蜜培养其产油效率虽低于利用葡萄糖培养,但从环境保护及原材料成本的角度考虑,用废糖蜜作为碳源发酵培养产生油脂更具优势。诱变菌株利用废糖蜜发酵后产生油脂经检测含有8种脂肪酸,其脂肪酸组成与植物油近似,其中不饱和脂肪酸含量占脂肪酸总量的82.4%。【结论】通过利用原生质体紫外诱变技术,成功选育出一株新的可利用廉价碳源的高产油海洋菌株,产油率达到49.4%,提高了21.2%。

    • 组成型表达chi基因的Bt工程菌株构建及其特性

      2014, 41(5):891-900. DOI: 10.13344/j.microbiol.china.130408

      摘要 (1414) HTML (0) PDF 2.31 M (1961) 评论 (0) 收藏

      摘要:【目的】通过构建能够组成型高效表达几丁质酶的苏云金芽胞杆菌工程菌株,以提高其抑真菌活性。【方法】首先通过PCR扩增获得Bti75菌株chiB全长及系列缺失启动子片段,与本室构建的启动子探测型载体pCB连接,转化Bti75菌株,通过β-半乳糖苷酶活性检测及β-半乳糖苷酶mRNA 的Real time-PCR检测,确定了一段长度为190 bp的组成型高效表达启动子。将这一启动子分别与Bti75自身几丁质酶基因chiA以及地衣芽胞杆菌(Bacillus licheniformis)的几丁质酶基因chiMY连接构建了组成型高效表达的工程菌株Bti75(pDA)和Bti75(pDM)。应用几丁质酶酶活检测、SDS-PAGE及酶谱分析检测了工程菌几丁质酶的表达情况。最后,通过检测工程菌发酵粗酶液对真菌孢子萌发和菌丝生长的影响,评估了工程菌对3种植物病原真菌的抗真菌活性。【结果】在没有诱导物存在的情况下,Bti75(pBPΔ7)菌株表达的β-半乳糖苷酶酶活和β-半乳糖苷酶mRNA的转录量分别是Bti75(pBP)菌株的7倍和2.5倍左右。在没有几丁质诱导的情况下,与野生株Bti75相比,工程菌株Bti75(pDA)和Bti75(pDM)的几丁质酶活性均提高了3.5倍左右。SDS-PAGE及酶谱分析证明目的几丁质酶在非诱导条件下达到组成型高效表达,抑真菌实验显示工程菌Bti75(pDA)和Bti75(pDM)抑制3种植物病原真菌的活性明显提高。【结论】发现190 bp的缺失启动子能够组成型高效表达不同来源的几丁质酶,无需诱导物的诱导,工程菌株就能展现良好的抗真菌能力。

    • >医学微生物学
    • 胞浆识别受体NODs及其信号通路在侵袭性肺曲霉病中的作用

      2014, 41(5):901-908. DOI: 10.13344/j.microbiol.china.130240

      摘要 (1345) HTML (0) PDF 7.40 M (1589) 评论 (0) 收藏

      摘要:【目的】研究天然免疫系统中胞浆识别受体NODs及其信号通路在小鼠侵袭性肺曲霉病(IPA)中的作用。【方法】小鼠随机分为正常对照组、正常+接种烟曲霉菌组(正常感染组)和免疫抑制+接种烟曲霉菌组(IPA组),经鼻吸入烟曲霉孢子后在不同时相点处死小鼠,无菌取肺组织分别进行病理切片,烟曲霉菌落计数,RT-PCR法、Western blot法动态检测小鼠感染烟曲霉菌过程中肺组织NOD1、NOD2、RIP2 mRNA表达,促炎细胞因子TNF-α含量的变化规律。【结果】鼻吸入烟曲霉菌后72 h时,IPA组肺组织出现严重炎症反应,并有大量的菌丝生成,同时各时相点的烟曲霉菌负荷均高于正常感染组;与正常感染组比较,IPA组NOD1、RIP2 mRNA持续低表达,而NOD2 mRNA则在感染最早期(24 h)异常高表达,而在随后的感染过程中一直处于低表达状态;正常小鼠感染烟曲霉菌后,肺组织中促炎细胞因子TNF-α在感染前期皆呈高表达,且最高表达量均出现在48 h或72 h,之后下降并恢复至正常水平。而IPA小鼠促炎症细胞因子TNF-α缓慢且低水平释放。【结论】NOD1、RIP2的表达受到长期抑制,NOD2在感染最早期的过度激活以及随后的抑制表达,引起促炎细胞因子低表达,可能导致了侵袭性肺曲霉的发生发展。

    • >简报
    • 分解玉米赤霉烯酮菌株的分离、鉴定及其产酶特征

      2014, 41(5):909-915. DOI: 10.13344/j.microbiol.china.130562

      摘要 (1608) HTML (0) PDF 1.53 M (2265) 评论 (0) 收藏

      摘要:【目的】从发酵食品材料中筛选出对玉米赤霉烯酮(ZEN)有分解作用的微生物,研究其分解效率及产酶特征并进行菌种鉴定。【方法】利用添加ZEN毒素类似物(PL)的固体培养基对25 种发酵食品材料进行初筛,获得毒素类似物耐受菌株,经过用ZEN复筛,得到高效分解ZEN的细菌。用高效液相色谱法(HPLC)分析培养物残留ZEN,评价菌株对ZEN的分解效率。初步分析该菌株产纤维素酶、木聚糖酶及β-葡萄糖苷酶的特性。通过微生物形态学、分子生物学方法进行菌种鉴定,确定该菌的系统分类学地位。【结果】从发酵食品材料中筛选出一株分解ZEN的菌株BF-B-3,经初步鉴定该菌株为枯草芽孢杆菌(Bacillus subtilis)。其ZEN分解率达62.48%,测定该菌产纤维素酶、木聚糖酶及β-葡萄糖苷酶活力分别为160.38、84.51和4.14 U/mL。【结论】枯草芽孢杆菌属于饲用微生物,生物安全性高,所分离到的枯草芽孢杆菌疑似株(Bacillus subtilis) BF-B-3菌株,可作为具有分解ZEN功能的益生菌使用,具有较好的应用前景。

    • >专论与综述
    • 工程纳米材料对污水生物处理影响的研究进展

      2014, 41(5):916-923. DOI: 10.13344/j.microbiol.china.130428

      摘要 (1569) HTML (0) PDF 345.27 K (2442) 评论 (0) 收藏

      摘要:工程纳米材料因其独特的物理化学性质被广泛应用于生产和生活中,但其潜在的风险正逐渐引起越来越多研究者的关注。目前国内外的研究主要探讨了工程纳米材料对模式微生物的毒性效应,但是对污水处理微生物的潜在影响尚缺乏系统和完整的报道。因此,本文综述了常见纳米材料对污水生物处理的影响,如碳、氮、磷的去除、甲烷化以及功能微生物种群结构演变等;同时还探讨了两种削减纳米银颗粒毒性的途径。综述内容为深入研究纳米材料对污水生物处理的潜在影响奠定了重要的理论基础。

    • 微生物完整基因组测定中的Gap closure策略

      2014, 41(5):924-933. DOI: 10.13344/j.microbiol.china.130345

      摘要 (2401) HTML (0) PDF 317.74 K (3897) 评论 (0) 收藏

      摘要:微生物基因组空缺区域(Gap)中可能存在重要的生物学信息,如果无法补齐所有Gap,不仅不能获得完整的基因组图谱,还会给后续的基因组信息解读造成很大困难。而基因组空缺区域填充(Gap closure)是获得微生物基因组完成图的关键,本文结合作者以及借鉴上海人类基因组研究中心在微生物基因组Gap closure中的经验,针对微生物基因组Gap closure常用的6种策略:参考序列比对、多引物PCR、基因组步移、基因组文库克隆末端测序、末端配对(Paired-End)以及基因组光学图谱技术进行综述。

    • 人体鼻咽部微生物群落多样性研究进展

      2014, 41(5):934-942. DOI: 10.13344/j.microbiol.china.130349

      摘要 (1555) HTML (0) PDF 284.84 K (3497) 评论 (0) 收藏

      摘要:定殖于鼻咽部的微生物与人体始终处于动态生态平衡,对于维持人体健康发挥着重要作用,也与多种上呼吸道疾病的发生发展有密切关系。鼻咽部微生物之间及其与宿主之间的相互作用是引发人体上呼吸道疾病的重要因素。微生物的培养方法与分子生物学技术的结合使人们越来越深入地了解人体鼻咽部微生物群落的组成和结构。定殖于人体鼻咽部的微生物以肺炎链球菌(Streptococcus pneumoniae)和流感嗜血杆菌(Haemophilus influenzae)等潜在致病菌为主。本文将分别从鼻咽部微生物与机体的平衡关系、鼻咽部微生物群落的研究方法以及鼻咽部微生物群落的组成及其相互关系三个方面,综述近年来鼻咽部微生物群落结构的相关研究进展,从而为指导实践提供可靠的理论依据。

    • 谷氨酸棒杆菌生产琥珀酸的代谢工程研究进展

      2014, 41(5):943-949. DOI: 10.13344/j.microbiol.china.130390

      摘要 (1561) HTML (0) PDF 471.89 K (2106) 评论 (0) 收藏

      摘要:琥珀酸是一种具有重要应用价值的四碳平台化合物。微生物法发酵生产琥珀酸以其社会、环境和经济优势展现出良好的发展前景。谷氨酸棒杆菌被广泛应用于氨基酸、核苷酸等高附加值化学品的工业化生产,在厌氧条件下细胞处于生长停滞状态,但仍能高效利用碳源合成有机酸,通过代谢工程改造的谷氨酸棒杆菌有望成为理想的琥珀酸生产菌株。结合近年来谷氨酸棒杆菌生产琥珀酸取得的最新成果,本文综述了构建高产琥珀酸工程菌株的代谢工程策略、底物的扩展利用,并展望了将来的研究方向。

    • 多烯类抗生素合成基因簇中ABC转运蛋白研究进展

      2014, 41(5):950-958. DOI: 10.13344/j.microbiol.china.130407

      摘要 (1664) HTML (0) PDF 1.19 M (2547) 评论 (0) 收藏

      摘要:ABC转运蛋白家族是一个广泛存在于不同生物细胞中且功能保守的膜蛋白亚家族;它们是一类单向底物转运泵,通常以主动转运方式完成多种分子的跨膜转运。随着抗生素合成基因簇相关研究的开展,越来越多的簇内ABC转运蛋白被鉴定出来,对其生物学功能的研究正逐渐成为热点。多烯类抗生素作为一类重要的抗真菌药物,能够有效避免真菌产生耐药性,具有非常重要的临床价值。本文以多烯类抗生素合成基因簇为对象,综述了在其中所发现的ABC转运蛋白的研究进展,综合分析了其结构特性与功能间的关系,并对研究应用进行了展望。

    • 组合生物学技术合成他克莫司类似物的研究进展

      2014, 41(5):959-967. DOI: 10.13344/j.microbiol.china.130410

      摘要 (1720) HTML (0) PDF 810.61 K (2626) 评论 (0) 收藏

      摘要:近年来组合生物学技术在开发抗生素类似物的研究中发挥着越来越重要的作用,在他克莫司类似物的组合生物合成中,通过应用外源合成前体取代烯丙基丙二酸单酰基和4,5-二羟基-1-烯-环己甲酸,以及应用模块化合成元件取代AM合成元件和改造后修饰合成元件,已经生产出11个他克莫司类似物,这些研究拓宽了人们对标准化合成前体和模块化合成元件的认识,为通过组合生物合成手段进行抗生素的更新换代提供指导。

    • 枯草芽孢杆菌近缘种群鉴定方法研究进展

      2014, 41(5):968-974. DOI: 10.13344/j.microbiol.china.130421

      摘要 (1810) HTML (0) PDF 384.24 K (4448) 评论 (0) 收藏

      摘要:枯草芽孢杆菌近缘种群(简称枯草群)是一群表型相似的革兰氏阳性、产芽孢的杆菌,目前该群已包括10个有效发表种。该群细菌广泛应用于生物技术、工业和农业等领域,因此实现菌株的快速准确鉴别与鉴定,确保其使用的安全性和有效性是首要条件。本文在本研究室进行的枯草群鉴定研究基础上,总结提出了基于形态和生化特性测定的传统经典方法和以分子生物学技术为基础的基因序列分析技术、特异PCR技术,并在实践上进行了大量的验证,对指导该种群的准确鉴定与快速鉴别具有重要应用价值。

    • 细菌感染显像剂的研究进展

      2014, 41(5):975-982. DOI: 10.13344/j.microbiol.china.130431

      摘要 (1481) HTML (0) PDF 303.84 K (2881) 评论 (0) 收藏

      摘要:细菌感染显像剂是利用一些示踪基团(如放射性核素及荧光染料)标记对细菌具有特异性识别作用的导向物,通过检测示踪信号定位细菌感染部位。到目前为止,针对细菌内的特异性位点(如细胞壁、酶、受体等)研制和开发了一系列细菌感染显像剂(包括核素标记的抗生素、噬菌体、抗菌肽、核苷及荧光染料标记的糖类等),这些显像剂能在细菌感染部位高度特异性聚集,有望应用于临床早期诊断细菌感染。本文对这些细菌感染显像剂的种类、浓集机制及研究现状进行了概述,并在此基础上,总结了理想细菌感染显像剂所应具有的特征,为进一步研究和开发新的细菌感染显像剂提供参考。

    • 幽门螺杆菌抗生素耐药机制研究进展

      2014, 41(5):983-989. DOI: 10.13344/j.microbiol.china.130659

      摘要 (1417) HTML (0) PDF 621.79 K (2634) 评论 (0) 收藏

      摘要:幽门螺杆菌(Helicobacter pylori,H. pylori)感染可引起消化性溃疡、胃粘膜相关淋巴组织淋巴瘤和胃癌。随着抗生素耐药性的问题越来越严重,耐药机制的研究也不断深入。分子检测方法,尤其是核酸检测技术,可高效、快速、准确地检测幽门螺杆菌抗生素耐药基因及突变,对幽门螺杆菌感染的临床治疗发挥重要的指导作用,同时也可对幽门螺杆菌抗生素耐药性进行大规模及时有效监控。本文讨论了关于幽门螺杆菌抗生素耐药机制并着重总结了相关耐药基因及突变。

    • >高校教改纵横
    • 基于Blackboard网络教学的综合改革在微生物双语教学中的应用研究

      2014, 41(5):990-995. DOI: 10.13344/j.microbiol.china.130888

      摘要 (1527) HTML (0) PDF 360.52 K (2199) 评论 (0) 收藏

      摘要:在Blackboard网络平台辅助下,微生物学双语教学建立了“听课、讨论、展示”三段式双语教学模式和“学习+反馈+修改”的动态管理模式。在良好的双语教学辅助内容、完善的交流讨论平台和教师课堂、网上的双重辅导帮助下,学生微生物学的综合成绩和考研成绩大幅提升,学生的创新能力得到增强。90%的学生赞成基于Blackboard网络平台辅助教学的双语课程进行综合改革。

    • 基于“卓越计划”培养目标的水处理微生物学课程改革研究与实践

      2014, 41(5):996-1003. DOI: 10.13344/j.microbiol.china.130371

      摘要 (1365) HTML (0) PDF 327.43 K (1876) 评论 (0) 收藏

      摘要:水处理微生物学是应用化学专业一门重要的专业基础课。为满足“卓越计划”的培养要求,结合我校现阶段教学中存在的问题,从教学大纲制定、课程内容设置、教学手段与方法改革以及建设课程考试评价体系四方面,对水处理微生物学课程进行了改革与实践。结果表明:通过课程改革与实践,学生的工程实践和科研创新能力得到增强,综合素质得到提高,为卓越工程师的成功培养奠定了基础。

    • >生物实验室
    • 格特隐球菌交配型的多重PCR鉴定

      2014, 41(5):1004-1008. DOI: 10.13344/j.microbiol.china.130396

      摘要 (1515) HTML (0) PDF 432.37 K (1981) 评论 (0) 收藏

      摘要:【目的】建立一种基于格特隐球菌α交配型位点内SXI1α基因和a交配型位点内SXI2a基因的多重PCR分析,用于快速鉴定格特隐球菌的交配型。【方法】设计针对格特隐球菌α交配型位点内SXI1α基因部分片段和格特隐球菌a交配型位点内SXI2a基因部分片段的特异性引物,用于多重PCR鉴定格特隐球菌的交配型;并与交配试验以及已报道的扩增α交配型位点的引物MFα、STE12α,及扩增a交配型位点的引物STE20a、STE3a进行扩增效果的比较。【结果】基于SXI1α基因和SXI2a基因的多重PCR分析,准确鉴定所有受试格特隐球菌(包括VGI、VGII、VGIII和VGIV基因型)的交配型,引物STE12α、STE20a和STE3a在常规PCR鉴定中不能鉴定部分菌株的交配型;66.7%的受试菌株不能发生交配,交配试验无法鉴定其交配型。【结论】建立的多重PCR方法明显优于常规PCR或交配试验鉴定。

    • >主编点评
    • 耐药结核分枝杆菌基因组信息挖掘

      2014, 41(5):1009-1009. DOI: 10.13344/j.microbiol.china.148005

      摘要 (1278) HTML (0) PDF 127.80 K (2397) 评论 (0) 收藏

      摘要:

    • 响应面模型分析在发酵产酶条件优化中的应用

      2014, 41(5):1010-1010. DOI: 10.13344/j.microbiol.china.148015

      摘要 (1191) HTML (0) PDF 149.18 K (1586) 评论 (0) 收藏

      摘要:

    • >主编点评文章
    • 两株超级广泛耐药结核分枝杆菌全基因组比较分析

      2014, 41(5):1011-1019. DOI: 10.13344/j.microbiol.china.130916

      摘要 (1629) HTML (0) PDF 1.35 M (3065) 评论 (0) 收藏

      摘要:【目的】结合现有数据,通过对两株临床超级广泛耐药的结核分枝杆菌全基因组的测序和分析,发现其型别相关的突变位点,解释发生广泛耐药的基因组突变机制。【方法】利用Solexa第二代测序技术对两株广泛耐药结核分枝杆菌(FJ05194和GuangZ0019)进行全基因组测序分析。以H37Rv为参考序列得到两株广泛耐药菌株的单核苷酸多态性(SNPs),构建系统发育树鉴定菌株型别,判断突变位点中型别相关和非型别相关的SNPs。定位SNPs所在的基因组区域,对型别相关的突变基因进行KEGG通路的富集分析,对非型别相关的突变基因和间隔区判断是否与耐药相关。【结果】两株广泛耐药菌株分别属于Lineage2和Lineage4型别,两菌株在碱基替换方面存在差异性,Lineage2型别相关的基因功能富集于ABC转运蛋白和核苷酸切除修复的通路。耐药方面,发现了已知的耐药相关基因的突变(rpoB、katG、rpsl、gyrA、gyrB、embB和ethA等),但卷曲霉素和卡那霉素相关的rrs、tlyA和eis启动子区域未发生突变,不足以解释其耐药性的产生。与最新报道的候选耐药基因比较,发现了卷曲霉素和卡那霉素相关的突变(Rv1393c、Rv0265c和narX等)和外排泵相关的pstB、Rv2333c和Rv2687c突变。【结论】结核分枝杆菌Lineage2型别相关的SNPs中含有影响结核分枝杆菌突变率和耐药性的突变。对于两株超级广泛耐药的结核菌,已知的激活药物或药靶相关的单耐药基因突变集合不能完全解释其广泛耐药性,还涉及新候选结核耐药基因、外排泵和补偿等其他潜在机制的相关基因突变。

    • 响应面模型分析高温蛋白酶菌株增殖和产酶关系

      2014, 41(5):1020-1027. DOI: 10.13344/j.microbiol.china.130217

      摘要 (1390) HTML (0) PDF 2.21 M (2094) 评论 (0) 收藏

      摘要:【目的】【方法】采用Box-Behnken法设计三因素三水平响应面实验,对比分析了高温蛋白酶高产菌株枯草芽孢杆菌BY25发酵过程中细菌生长与产酶之间的关系。【结果】实验表明,细菌生长与产酶的关系在各因素交互影响下变化显著。在中低水平的有机氮源添加条件下,细菌的大量繁殖显著抑制了蛋白酶产量,而在高水平的有机氮源添加条件下,细菌量的增长对产酶的作用由抑制转为促进。【结论】该结果表明,产酶诱导物有机氮源豆制品废渣的添加很可能显著提高了枯草芽孢杆菌群体中产酶菌的比率,而在没有合适诱导物的情况下通过增加细菌量并不能有效提高蛋白酶产量。

    • >回顾点评
    • 重金属污染土壤中微生物的多样性

      2014, 41(5):1028-1028. DOI: 10.13344/j.microbiol.china.149005

      摘要 (1472) HTML (0) PDF 155.08 K (2018) 评论 (0) 收藏

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