2011, 38(11):1740-1746.
摘要:用二苯基苦基苯肼(DPPH)自由基法, 首次对拟细羽束梗孢(Isaria gracilioides RCEF3 279)菌丝体的不同溶剂提取物进行了自由基清除活性的定性定量分析, 发现其甲醇提取物具有较强的清除自由基活性, 当菌丝浓度为10 g/L时, 其甲醇提取物的自由基清除率达到了92.4%±0.3%。DPPH自显影-薄层色谱分析结果显示有4个具自由基清除活性主要成分。高分辨液质联用和活性联合分析发现, 提取物中4个具自由基清除活性成分的可能分子式分别为C15H16NO3 (1)、C32H40N2O18 (2)、C30H55N5O5 (3)和C17H14N2O2 (4)。经天然产物数据库查询发现, 化合物3和4可能分别为Viscumamide和Dehydrocyclopepti, 这两个化合物在虫生真菌代谢产物中属首次发现。数据库查询没有发现与分子式C15H16NO3和C32H40N2O18匹配的结构式, 因此化合物1和2可能为新化合物。
2011, 38(11):1611-1617.
摘要:在肺炎克雷伯杆菌(Klebsiella pneumoniae)代谢甘油生产1,3-丙二醇(1,3-PD)的过程中, 为了减少有毒中间产物3-羟基丙醛(3-HPA)的积累, 可将其转化为3-羟基丙酸(3-HP), 从而实现1,3-丙二醇和3-羟基丙酸的联产。克隆来自于酿酒酵母的NAD+依赖型的乙醛脱氢酶(ALDH)的基因aldh4, 构建了表达载体pKP-aldh, 转化K. pneumoniae, 得到了有效表达乙醛脱氢酶的重组肺炎克雷伯杆菌(K. pneumoniae A+)。在此基础上, 使用紫外诱变联合菌种驯化的方法对K. pneumoniae A+进行筛选, 获得了可耐受较高3-HP浓度(≥35 g/L)的重组肺炎克雷伯杆菌K. pneumoniae A+5-3。发酵实验结果表明, K. pneumoniae A+5-3可将3-HPA转化为3-HP, 能够同时利用甘油耦联生产3-HP和1,3-PD, 产量分别达到5.0 g/L和74.5 g/L。
2011, 38(11):1618-1625.
摘要:通过构建16S rDNA克隆文库, 对承德地区两温泉中的细菌多样性水平及系统发育关系进行了初步研究。研究表明: 68 °C的A11文库中阳性克隆的16S rDNA序列分属5个细菌类群, 分别为Firmicutes (6.25%)、Deinococcus-Thermus (25.0%)、Gammaproteobacteria (12.5%)、Betaproteobacteria (50.0%)、Alphaproteobacteria (6.25%); 而74.5 °C的A12文库仅属于一个细菌类群: 厚壁菌门(Firmicutes)。两温泉中细菌多样性的差异表明, 温度是影响温泉中细菌多样性水平的重要因素。此外, A11文库中克隆的16S rDNA序列与许多已知的可产色素的好氧菌相似性很高, 而A12文库中的细菌多数为专性厌氧或兼性厌氧型, 其中厌氧芽孢杆菌属(Anoxybacillus)中的Anoxybacillus flavithermus可以作为研究泉华形成的理想材料。
2011, 38(11):1626-1631.
摘要:首先对新分离的、能高效降解甲醛的两菌株A1和A2在形态学特征、生理生化特性及16S rDNA序列分析等方面进行了系统研究; 随后通过测定在液体培养过程中甲醛浓度的变化, 确定新分离菌株A1、A2降解溶液中甲醛的性能; 最后利用菌株A1、A2分别进行生物填料塔的挂膜实验, 确定其对甲醛气体的净化性能。结果表明: 菌株A1属于假单胞菌属(Pseudomonas), 菌株A2为鞘氨醇单胞菌属(Sphingomonas); 当甲醛初始浓度<1 200 mg/L时,菌株A1、A2都能完全降解溶液中的甲醛, 当甲醛浓度增高至1 600 mg/L时, 菌株A1在48 h后的甲醛降解率为50%, 菌株A2在104 h后的甲醛降解率为74.3%; 菌株A1、A2对甲醛气体的净化效率均能达到99%以上, 菌株A1的甲醛生化去除量能达到26.4 mg/(L?h), 菌株A2的甲醛生化去除量可达20.6 mg/(L?h)。
2011, 38(11):1632-1638.
摘要:比较研究泉州西湖沉积物中氨氧化细菌(AOB)和亚硝酸盐氧化细菌(NOB)的分布及氨氧化潜力和亚硝酸盐(NO2?)氧化潜力。结果表明: 西湖沉积物中存在高浓度的有机质(OM)、总氮(TN)和氨氮。AOB生物量为1.1×106?6.4×106 个/g干土, 显著高于NOB生物量4.2×105?7.4×105 个/g 干土(配对t-检验, P<0.05)。对于NOB, 硝化杆菌属(Nitrobacter)和硝化螺菌属(Nitrospira)同时存在于西湖沉积物中, 以Nitrobacter为优势种群。AOB和NOB生物量的差异一定程度上导致西湖沉积物中氨氧化潜力显著高于NO2?氧化潜力(配对t-检验, P<0.05), NO2?氧化过程成为硝化作用的限制步骤。另外, 西湖沉积物中存在的较高浓度氨氮, 一方面促进了AOB的生长和活性, 导致较高速率的氨氧化过程, 另一方面却对亚硝酸盐氧化过程产生选择性抑制, 这也是导致NO2?氧化潜力较低的主要原因之一。
2011, 38(11):1639-1646.
摘要:为了探寻有效的控制副溶血弧菌的方法, 从水产品市场的污水中分离出来一株烈性噬菌体qdvp001。采用双层平板法分离纯化噬菌体qdvp001, 电镜观察其形态特征, 并利用双层平板法测定其生理特性, 包括热稳定性试验、最适pH、最佳感染复数及一步生长曲线, 然后提取基因组进行酶切和序列分析。结果显示该烈性噬菌体qdvp001头部直径大约为79 nm, 尾长大约118 nm, 属于肌尾噬菌体科。它对60 °C以下的温度耐受力较强, 最适pH为7.0?8.0左右, 最佳感染复数是0.000 1, 感染宿主菌的潜伏期约20 min, 裂解期约70 min, 并获得部分DNA片段的序列。将获得的DNA序列在NCBI上进行比对, 结果显示, qdvp001与其他噬菌体的同源性较低。该噬菌体很可能是一种新发现的噬菌体。
2011, 38(11):1647-1656.
摘要:根据GenBank收录的sikSAD基因序列, 采用反转录PCR技术从新疆雪莲(Sasussured involucrata Kar. et Kir)中克隆了sikSAD基因, 并构建了pYES2-sikSAD大肠杆菌/酵母穿梭表达载体, 通过电击法转化酿酒酵母S288C菌株, 并利用PCR和SDS-PAGE对转化酿酒酵母进行鉴定, 最后通过低温胁迫和酒精胁迫进行抗性初步分析及方差分析。结果表明: 低温胁迫实验中, 转sikSAD基因酿酒酵母在低温条件下仍能存活, 并且在温度恢复到28 °C时能迅速生长, 生长状态良好, 不饱和脂肪酸油酸的含量有明显的变化。酒精胁迫实验中, 其能耐受一定浓度的酒精, 并且耐受能力比非转基因酿酒酵母提高了十几个百分点。可见, 在低温胁迫和高浓度酒精条件下, 转新疆雪莲sikSAD基因酿酒酵母表现出了优良的活性和生长优势, 显示出较强的抗性特征, 用分子手段改造酿酒酵母, 为工业生产提供高质量的酿酒酵母奠定实验基础。
2011, 38(11):1657-1665.
摘要:采用改造的酿酒酵母表达载体pYES2-GSL构建了拟青霉Paecilomyces sp. FLH30表达cDNA文库, 刚果红平板法筛到一内切β-1,3(4)-葡聚糖酶基因(PsBg16A), 全长cDNA为1 217 bp, 完整开放阅读框(ORF) 951 bp, 编码316个氨基酸, 属于糖苷水解酶16家族。去信号肽的PsBg16A克隆入表达载体pET28a(+)并在E. coli BL21成功表达, 经16 °C 20%乳糖诱导24 h, 酶活达482 U/mL。重组PsBg16A可水解大麦葡聚糖、地衣多糖和昆布多糖, 显示PsBg16A为典型的β-1,3(4)-葡聚糖酶(EC 3.2.1.6), 重组酶最适pH和温度分别为7.0和65 °C, 对大麦葡聚糖、地衣多糖和昆布多糖的Km 分别为3.12、4.86和10.32 g/L。
2011, 38(11):1666-1672.
摘要:以添加CCCP (羰基氰化物间氯苯腙, Carbonyl cyanide m-chlorophenylhydrazone)的海洋绿藻亚心型四爿藻光生物制氢为研究体系, 使用作用于光合系统不同位点的抑制剂研究该藻产氢过程不同时段的代谢途径。结果表明: 四爿藻光生物产氢前期电子主要来自PS II光解水以及胞内分解代谢, 电子经由光合电子传递链传递至氢酶产生氢气; 而后期释放的氢气则是通过不依赖光合电子传递链的发酵途径产生。产氢过程厌氧发酵代谢途径主要产物是乙酸、乙醇, 其中乙醇代谢途径和氢酶竞争NAD(P)H, 不利于氢气的积累。
2011, 38(11):1673-1678.
摘要:从土壤肥力与微生物因子探索连茬障碍机理, 以期为其提供科学依据。研究草莓番茄轮作(RST)、番茄连作4年(CT4)和番茄连作10年(CT10) 3种蔬菜种植模式根际与非根际土壤微生物区系及生理菌群, 并对土壤肥力与微生物生物因子进行主成分分析。结果表明根际土壤微生物三大类群和生理菌群数量均高于非根际, 根际效应显著。番茄连作根际与非根际土壤细菌和放线菌数量呈现先增加后减少趋势; 真菌数量呈线型增加趋势, CT4和CT10在根际与非根际较RST分别增加9.09%和2.11%、75.48%和57.72%。番茄连作根际土壤硝化细菌和好气性自生固氮菌数量的减少, 氨化细菌与好气性纤维素分解菌在短期连作表现为增加长期减少的变化趋势; 解钾菌、无机磷和有机磷细菌数量在根际与非根际土壤均减少。在6种研究的种植模式中, RST根际土壤状况最好, 其次为CT4的根际与RST非根际土壤, CT10的根际土壤、CT4与CT10非根际土壤状况最差。结论是蔬菜连作造成土壤质量下降, 连作年限越长下降越显著。
2011, 38(11):1679-1687.
摘要:为了研究III型泌出效应因子在丁香假单胞大豆致病变种中的作用, 利用反向PCR技术, 首次从丁香假单胞大豆致病变种全基因组中克隆得到两个效应因子HopAB1和HopAF1基因的同源物, 分别命名为HopAB1s和HopAF1s。生物信息学分析表明, HopAB1s基因全长是1 572 bp, 编码523个氨基酸; HopAF1s基因全长是855 bp, 编码284个氨基酸。即基因的登录号分别为JF826562和JF826563。保守功能区预测显示HopAB1s在N末端包含一个E3泛素连接酶功能区。将这2个基因克隆到PVX二元表达载体并转化农杆菌, 利用农杆菌介导的瞬时侵染技术在本生烟中表达, 发现2个效应因子均能抑制由鼠凋亡因子激发的细胞程序性死亡; 将烟草疫霉接种在表达效应基因的区域, 发现效应因子能促进烟草疫霉侵染烟草, 因此本研究得到的两个效应因子是免疫抑制因子, 为进一步研究该菌的致病机理奠定基础。
张可心 , 蔺利娟 , 韩宗玺 , 邵昱昊 , 刘胜旺 , 马得莹
2011, 38(11):1688-1697.
摘要:为克隆与表达鸭β-防御素5 (AvBD5)基因及测定其生物学特性, 采用RT-PCR方法从鸭肺脏组织中扩增到鸭AvBD5, 将测得的序列与已发现的禽β-防御素和部分哺乳类动物β-防御素的氨基酸序列构建进化树进行同源性分析。结果显示鸭AvBD5 cDNA大小为201 bp, 编码66个氨基酸残基, 内含6个位置保守的半胱氨酸残基, 分别在分子内形成Cys1?Cys5、Cys2?Cys4和Cys3?Cys6共3对二硫键, 与鸡AvBD5氨基酸同源性高达97%。进一步将其亚克隆到大肠杆菌pGEX-6p-1载体中进行原核表达。重组GST融合蛋白经纯化后, 通过菌落计数法测定其体外抗菌活性, 盐离子浓度对其抗菌活性的影响, 以及该重组GST融合蛋白对溶血活性的影响。鸭AvBD5重组蛋白分子量约为32 kD, 具有良好的抗菌活性, 对11种细菌均有不同程度的抑制作用, 高盐浓度对其抗菌活性有一定影响。此外, 该重组蛋白对红细胞溶血活性极低。
2011, 38(11):1698-1704.
摘要:噬菌体治疗技术由来已久。噬菌体治疗的研究始于上世纪初, 之后由于抗生素的出现及其他原因在美国和西欧等国家中断。近年来, 全球范围的细菌耐药性使得科学家们重新审视和评估噬菌体治疗技术, 显示出巨大潜力。论述噬菌体发现历程及早期研究、人类及动物细菌感染的应用、噬菌体治疗与抗生素的不同之处、存在的问题等, 并探讨噬菌体技术可能的发展应用方向。
2011, 38(11):1715-1717.
摘要:根据微生物学教学实践经验, 提出培养大学生逆向思维能力来提升其创新意识与能力, 并通过克服思维定势和培养学生反向思索能力两种途径加以实践。
2011, 38(11):1718-1720.
摘要:细菌的结构是病原生物学课程教学中最为基础的教学内容。随着科学技术和研究方法的发展, 人们对细菌结构的认识也愈加深入。对国内教材普遍采用的细菌“特殊结构”概念提出不同的观点, 试与同行切磋探讨。
2011, 38(11):1726-1729.
摘要:探讨了微生物双语教学中采用交互式教学以发挥学生主体地位以及教师鼓励作用的教学策略。为了“有助于达到人才培养目标”又保证培养质量, 精选了英文原版教材和国内选编教材; 基于双语教学资源平台, 了解学情, 灵活把握双语教学的中英文比例; 通过微生物理论与实践相结合和英文演讲辩论等提升课堂活力; 适度改革双语教学考核等方式提高微生物双语教学效果。