中国科学技术信息研究所研制出中国科技学术期刊综合评价指标体系，针对每年出版的《中国科技期刊引证报告》（核心版）收录的中国科技核心期刊的二十余项文献计量指标，采用科学计量学方法，并由专家打分确定重要指标的权重，分学科对每种期刊进行综合评定，择优选择各学科类别中最重要的期刊作为杰出学术期刊。 

《微生物学通报》因综合评价总分在“微生物学、病毒学类期刊”中名列前茅，第10年蝉联“百种中国杰出学术期刊”称号。