科微学术

微生物学通报

点击排行

  • 显示方式:
  • 简洁模式
  • 摘要模式
  • 1  九龙江河口及厦门污水处理设施抗生素抗性基因污染分析
    何基兵 胡安谊 陈猛 胡友彪 于昌平
    2012, 39(5):0683-0695.
    [摘要](19906) [HTML](0) [PDF 760.88 K](7045)
    摘要:
    【目的】近年来由于抗生素的滥用, 导致了多药物抗性超级细菌的产生, 有关抗生素抗性基因(Antibiotic resistance genes, ARGs)在环境介质中分布、迁移和扩散已经引起人们的广泛关注。针对九龙江河口及厦门污水处理设施抗生素抗性基因污染情况开展研究。【方法】通过定性PCR研究九龙江河口水体、沉积物和厦门污水处理设施活性污泥中4种磺胺类、13种四环素类ARGs及2种整合子基因的污染情况, 并选择四环素类tet(W)基因进行克隆文库测序分析。【结果】除tet(O)和tet(S)外, 其他基因均被检出。不同环境介质中的ARGs及整合子基因检出率为活性污泥(0.86)>沉积物(0.57)>水体(0.24)。在淡水和淡盐水中, sul(l)、int(1)、tet(A)、tet(C)、tet(E)、tet(M)和tet(W)的检出率要高于海水, 表明九龙江上游可能是ARGs的污染源之一。【结论】主成分分析表明污水处理设施是ARGs的高发载体; 沉积物是ARGs的稳定载体; 而水体中的ARGs易于分解。此外, tet(W)基因克隆文库分析表明, 厦门污水处理设施也可能是九龙江河口及厦门沿岸的ARG污染源。
    2  实时荧光定量PCR中内参基因的选择
    赵文静 徐洁 包秋华 陈永福 张和平
    2010, 37(12):1825-1829.
    [摘要](19664) [HTML](0) [PDF 791.56 K](35233)
    摘要:
    实时荧光定量PCR技术是分析基因表达谱的一种常用方法, 在分析中选择合适的内参基因对数据进行校正是得到可信数据的关键。以Lactobacillus helveticus H9为研究对象, 应用实时荧光定量PCR技术, 评价了5种常用内参基因ldh、recA、rpoB、gapdh和16S rRNA的表达稳定性, 通过geNorm和NormFinder程序进行数据分析, 结果表明5个候选内参基因在菌株不同的发酵时间点表达相对都较为稳定, 结合两种分析得到其中最为稳定的基因是ldh, 适合于用作后续实时荧光定量PCR试验中的内参基因。
    3  SCI收录的微生物科学期刊信息
    李 红
    2008, 35(6):0967-0976.
    [摘要](16160) [HTML](0) [PDF 0.00 Byte](16936)
    摘要:
    以SCI期刊引用报告JCR最新网络版 (2006年) 为依据, 对其收录的88种微生物科学期刊进行了统计分析。结果显示:这88种期刊由美、英、荷兰、德和日本等16个国家用3种语言出版, 且主要语言是英语; 年均载文量165篇, 平均被引频次5226.64次; 影响因子、即时指标和被引半衰期的平均值分别为3.154、0.45和5.84年。最后根据影响因子的大小, 列出影响因子超过2.0的55种核心期刊相关信息。
    4  iTRAQ结合2D LC-MS/MS技术在草菇不同生长发育时期蛋白质组分析中的应用
    刘靖宇 江玉姬 谢宝贵 陈炳智 廖伟 邓优锦
    2012, 39(6):0853-0864.
    [摘要](13265) [HTML](0) [PDF 1.10 M](8354)
    摘要:
    【目的】旨在采用iTRAQ标记结合二维液相色谱串联质谱技术对草菇不同生长发育阶段的差异蛋白质组进行研究。【方法】首先将提取的草菇不同生长阶段蛋白样品进行SDS-PAGE分析, 其次将经二维液相色谱串联质谱技术获取的串联质谱数据通过MASCOT软件搜库, 之后对鉴定蛋白质数据进行了主成分分析(Principal component analysis, PCA)、层次聚类(Hierarchy clustering)分析、K-均值(K-means)聚类和Gene Ontology (GO)注释分析。【结果】试验结果显示, 共计获得2 335个不同肽段, 鉴定到1 039个蛋白质, 其中1 030个蛋白质具有定量信息。在子实体阶段中显著上调蛋白质64个, 下调蛋白质150个。生物信息学分析表明, iTRAQ标记技术结合二维液相色谱串联质谱可对不同生长发育时期的草菇蛋白样品进行有效地分离和鉴定。【结论】这一研究结果为深入研究草菇乃至其他大型担子菌子实体形成和发育的分子机制提供借鉴。
    5  土壤细菌DNA提取及多样性分析的T-RFLP方法
    葛芸英 陈 松 胡 兰 凃 政
    2008, 35(1):131-136.
    [摘要](9712) [HTML](8) [PDF 0.00 Byte](18032)
    摘要:
    获得高质量的土壤总DNA是土壤细菌生态学的关键步骤之一。实验通过综合应用两个试剂盒(Soilmaster kit和DNA IQTM系统)的优点进行土壤样品总DNA的提取, 结果证明该方法是一种快速、有效、灵敏、稳定的土壤DNA提取方法。另外尝试将16S rDNA 序列和T-RFLP(Terminal restriction fragment length polymorphism)技术引入土壤细菌DNA群落多样性的研究中, 证明T-RFLP是一种有力的土壤细菌多样性分析工具。
    6  抗菌活性海洋真菌HN4-13的鉴定及其发酵优化
    郭雷 朱文成 刘玮炜 丁国伟 张越乾 张守禄 邱月 谢宇
    2013, 40(6):951-958.
    [摘要](8106) [HTML](0) [PDF 11.37 M](24664)
    摘要:
    【目的】鉴定一株来源于连云港近岸海域沉积物并具有分泌抗菌活性代谢产物的真菌菌株HN4-13, 优化其合成抗菌活性物质的发酵条件。【方法】通过形态学观察及ITS 序列分析方法对菌株HN4-13进行鉴定; 通过基础发酵培养基筛选、碳氮源及无机盐的单因素试验, 继而采用正交试验设计优化其合成抗菌活性物质的发酵条件。【结果】菌株HN4-13被鉴定为黄柄曲霉(Aspergillus flavipes), 其分泌抗菌活性产物的发酵条件为: 4%蔗糖、0.5%蛋白胨、0.1% KCl、0.06% NaH2PO4、28 °C、1%接种量、160 r/min培养9?d。【结论】实验结果为进一步分离纯化菌株HN4-13所产抗菌活性代谢产物提供了基础。
    7  嗜热枯草芽孢杆菌普鲁兰酶基因的表达与重组酶的性质
    韩鹏 周鹏 闫巧娟 杨绍青 江正强
    2011, 38(12):1755-1761.
    [摘要](7603) [HTML](0) [PDF 627.26 K](6252)
    摘要:
    克隆嗜热枯草芽孢杆菌WY-34普鲁兰酶基因并在大肠杆菌中进行表达, 对重组酶进行纯化和酶学性质研究, 根据枯草芽孢杆菌的普鲁兰酶蛋白序列, 设计PCR引物对WY-34的普鲁兰酶基因进行克隆及异源表达。对表达蛋白的最适pH、pH稳定性及最适温度、温度稳定性等特性进行研究, 并测定重组普鲁兰酶的底物特异性。将普鲁兰酶基因pluA克隆及分析序列后, 发现基因长度为2.2 kb, 编码718个氨基酸, 在大肠杆菌中异源表达。通过Ni-IDA亲和层析一步纯化得到比活力为93.2 U/mg的纯酶, SDS-PAGE和凝胶层析测定的分子量分别为76.2 kD和74.3 kD。酶学性质研究表明, 该酶的最适温度为40 °C, 在温度不高于45 °C条件下稳定; 最适pH为6.0, 同一温度下pH 6.0?9.0范围内处理30 min可以保持80%以上的酶活力, 此酶对普鲁兰糖有很强的底物特异性。此重组普鲁兰酶的酶学性质表明此酶具有一定的工业化应用价值。
    8  一种纤维素分解菌鉴别培养基
    叶姜瑜;
    1997, 24(4).
    [摘要](7427) [HTML](9) [PDF 0.00 Byte](5345)
    摘要:
    一种新的鉴别性纤维素刚果红培养基,含酸洗纤维素为唯一碳源和染料刚果红,产纤维素酶菌株在其上形成浓郁红色水解圈,明显区别于其它微生物类群,方便纤维素分解菌的筛选和计数。
    9  c-di-GMP信号途径对细菌致病性的调控作用
    管文静 吴茂森 何晨阳
    2009, 36(3):0427-0431.
    [摘要](7226) [HTML](0) [PDF 420.16 K](11421)
    摘要:
    环鸟苷二磷酸(c-di-GMP)是一种广泛存在于细菌中的新型第二信使。鸟苷酸环化酶(DGC)和磷酸二脂酶(PDE)分别控制了c-di-GMP的合成和降解, 其中DGC活性由GGDEF结构域决定, PDE活性由EAL和HD-GYP结构域决定。c-di-GMP调控着细菌多种生物学功能, 抑制毒性因子产生和运动性, 促进生物膜形成。c-di-GMP下游是一个包括转录、翻译以及翻译后等多层次的复杂调控网络。本文结合本室有关水稻白叶枯病菌的研究结果, 综述近年来国内外在c-di-GMP研究领域的最新进展。
    10  木质纤维素固体基质发酵物中半纤维素、纤维素和木素的定量分析程序
    王玉万; 徐文玉;
    1987, 14(2).
    [摘要](6850) [HTML](7) [PDF 0.00 Byte](5309)
    摘要:
    拟定了木质纤维素固体基质发酵物中半纤维素、纤维素和木素的定量分析程序。本程序是将中性洗涤剂法、2M盐酸水解法、72%硫酸水解法、地衣酚比色定糖法和蒽酮比色定糖法加以综合应用而成,在具有一般化学分析条件的实验室都可使用。本程序可以同时进行多个试样的分析。因此,对于进行对比性探讨发酵物中半纤维素、纤维素和木素的含量及其转化动力学的研究,本程序尤其实用。
    11  硝化细菌中亚硝酸盐氧化还原酶的研究进展
    张 星 林炜铁 朱雅楠
    2008, 35(11):1806-1810.
    [摘要](6694) [HTML](0) [PDF 496.52 K](7402)
    摘要:
    亚硝酸盐氧化还原酶(nitrite oxidoreductase, NXR)是硝化细菌将亚硝酸盐氧化为硝酸盐的关键酶, 广泛存在于亚硝酸盐氧化菌中。由于它是可溶性的膜内酶, 其催化机理与膜内电子传递密切联系, 给它的研究带来了一定的困难。本文综述了多年来国内外研究者从不同方面对NXR研究的成果, 详细论述了NXR的组成结构、工作机理以及不同因子对其活性的影响, 总结了近几年应用于研究NXR的新方法, 并展望了对NXR研究的发展方向及其意义。
    12  具有ACC脱氨酶活性的杜仲内生细菌的分离鉴定及其抗菌活性
    龚凤娟 恩特马克·布拉提白 张宇凤 吾鲁木汗·那孜尔别克
    2011, 38(10):1526-1532.
    [摘要](6618) [HTML](0) [PDF 526.16 K](6807)
    摘要:
    采用富集筛选法从杜仲根中分离到5株具有ACC脱氨酶活性的内生细菌, 利用纸片法测定它们的抑菌活性, 通过形态特征、生理生化试验和16S rRNA序列分析对分离菌株进行鉴定。结果显示, 5株杜仲内生细菌均具有较高的ACC脱氨酶活性, 其中4株菌对大肠杆菌CGMCC1.1103和枯草芽孢杆菌CGMCC1.769均有较好的抑菌活性, 通过生理生化试验和16S rRNA序列分析, 将菌株JDM-2、JDM-8、JDM-11、JDM-14和JDM-19分别鉴定为Pseudomonas koreensis、肺炎克雷伯氏菌(Klebsiella pneumoniae)、路德维希肠杆菌(Enterobacter ludwigii)、变栖克雷伯氏菌(Klebsiella variicola)和阿氏肠杆菌(Enterobacter asburiae)。
    13  梭菌属分类研究进展:现状和展望
    Paul A.Lawson
    2016, 43(5):1070-1074. DOI: 10.13344/j.microbiol.china.166105
    [摘要](6466) [HTML](1790) [PDF 552.82 K](4737)
    摘要:
    目前构成梭菌属的微生物在系统发育和表型特征上不一致。多相分类数据表明,梭菌属物种之间差异大。大量基于16S rRNA 基因的系统发育研究表明,梭菌属应被限定为梭菌属类群I,作为狭义梭菌属(Clostridium sensu stricto)。尽管有这方面认识,梭菌属新物种仍持续增加,这些新物种并不能与梭菌属类群I 和标准种丁酸梭菌(C. butryicum)形成一致分支,引发梭菌属分类上的混乱。本文明确了梭菌属物种的范围,即只包括模式种和梭菌属类群I。此外,4 个物种念珠状真杆菌(Eubacterium moniliforme)、旋舞真杆菌(Eubacterium tarantellae)、最大八叠球菌(Sarcina maxima)和胃八叠球菌(Sarcina ventriculi)应被调至梭菌属,分别命名为念珠状梭菌(Clostridium moniliforme)、旋舞梭菌(Clostridium tarantellae)、最大梭菌(Clostridium maximum)和胃梭菌(Clostridium ventriculi)。一个新属哈撒韦氏菌属(Hathewaya)被提议成立,3 个梭菌属物种溶组织梭菌(Clostridium histolyticum)、泥渣梭菌(Clostridium limosum)和解朊梭菌(Clostridiumproteolyticum)重新归为溶组织哈撒韦氏菌(Hathewaya histolytica)、泥渣哈撒韦氏菌(Hathewaya limosa)和解朊哈撒韦氏菌(Hathewaya proteolytica),其中Hathewaya histolytica 为模式种。
    14  土壤氮素转化的关键微生物过程及机制
    贺纪正 张丽梅
    2013, 40(1):98-108.
    [摘要](6001) [HTML](0) [PDF 687.01 K](12269)
    摘要:
    微生物是驱动土壤元素生物地球化学循环的引擎。氮循环是土壤生态系统元素循环的核心之一, 其四个主要过程, 即生物固氮作用、氨化作用、硝化作用、反硝化作用, 均由微生物所驱动。近10年来, 随着免培养的分子生态学技术和高通量测序技术等的发展, 在硝化微生物多样性及其作用机理、厌氧氨氧化过程和机理等研究方面取得了突破性进展。本文重点阐述了我国有关土壤硝化微生物方面的研究进展, 在此基础上, 简要介绍了反硝化微生物和厌氧氨氧化及硝酸盐异化还原成铵作用的研究进展, 并对今后的研究工作提出了展望。今后土壤氮素转化微生物生态学的研究, 应瞄准国际微生生态学发展的前沿, 加强新技术新方法的应用, 结合我国农业可持续发展、资源环境保护和全球变化研究的重大需求, 重点开展以下几方面的工作: (1) 开展大尺度上土壤硝化作用及氨氧化微生物分布的时空演变特征及驱动因子的研究; (2) 加强氮素转化关键微生物过程与机理的研究, 并与相关过程的通量(如氨挥发、N2O释放)和反应速率(如矿化速率、硝化速率)关联起来; (3) 在特定生态系统中系统研究各个氮转化过程的耦合关系, 构建相关氮素转化和氮素平衡模型, 为定向调控土壤氮素转化过程, 提高氮素利用效率并减少其负面效应提供科学依据。
    15  pNPG法测定纤维素酶系中β-葡萄糖苷酶
    姚卫蓉; 丁霄霖;
    1998, 25(3).
    [摘要](5918) [HTML](8) [PDF 0.00 Byte](3465)
    摘要:
    本文报道快速测定β-葡萄糖昔酶活力的方法。此法以pNPG为底物,利用β-葡萄糖苷酶将其分解成pNP及葡萄糖,而pNP在碱性条件下显色的原理测定酶活。通过对各测定条件的研究,确定了测定方法。
    16  以SecA蛋白为“动力泵”的细菌Sec蛋白转运途径
    赵莉莉 余利岩
    2008, 35(7):1119-1123.
    [摘要](5832) [HTML](0) [PDF 0.00 Byte](7149)
    摘要:
    细菌细胞中, 三分之一的蛋白质是在合成后被转运到细胞质外才发挥功能的。其中大多数蛋白是通过Sec途径(即分泌途径 secretion pathway)进行跨膜运动的。Sec转运酶是一个多组分的蛋白质复合体, 膜蛋白三聚体SecYEG及水解ATP的动力蛋白SecA构成了Sec转运酶的核心。整合膜蛋白SecD, SecF 和YajC 形成了一个复合体亚单位, 可与SecYEG相连并稳定SecA蛋白的膜结合形式。SecB是蛋白质转运中的伴侣分子, 可以和很多蛋白质前体结合。SecM是由位于secA基因上游的secM基因编码的, 可调节SecA蛋白的合成量, 维持细胞在不同环境条件下的正常生长。新生肽链的信号肽被高度保守的SRP特异性识别。伴侣分子SecB通过与细胞膜上的SecA二聚体特异性结合将蛋白质前体引导至Sec转运途径, 起始转运过程。结合蛋白质前体的SecA与组成转运通道的SecYEG复合体具有较高的亲和性。SecA经历插入和脱离细胞内膜SecYEG通道的循环, 为转运提供所需的能量, 每一次循环可推动20多个氨基酸的连续跨膜运动。
    17  荚膜唾液酸对猪链球菌激活巨噬细胞TLR2-AKT-NF-κB信号通路影响的研究
    朱静 胡丹 刘丽娜 张锦海 张凤玉 郝丽娜 耿美玲 郑峰 朱进 潘秀珍 王长军
    2013, 40(6):1058-1067.
    [摘要](5679) [HTML](0) [PDF 15.50 M](14018)
    摘要:
    【目的】探索猪链球菌2型感染后单核/巨噬细胞启动信号转导通路机制, 探讨荚膜唾液酸对细菌激活巨噬细胞TLR2-AKT-NF-κB信号通路的影响。【方法】以小鼠巨噬细胞系RAW264.7细胞为研究对象, 采用RT-PCR、Western blotting、免疫荧光和ELISA法分别检测猪链球菌2型野毒株、唾液酸缺失突变株、唾液酸回复突变株感染后不同时间点巨噬细胞TLR2 mRNA转录水平、AKT磷酸化水平、NF-κB激活程度以及前炎症因子TNF-α分泌水平; 再分别用TLR2阻断剂和PI-3K抑制剂预处理巨噬细胞, 检测上述分子的表达水平。【结果】唾液酸缺失株可选择性的活化信号转导通路途径。RT-PCR结果表明, 缺失株TLR2 mRNA表达水平自1 h开始升高, 1.5 h达高峰后有所下降; Western blotting显示, 缺失株TLR2蛋白表达水平7 h达高峰, 9 h下降; p-AKT 水平1.5?5 h持续稳定在高峰水平, 7 h后开始下降; 免疫荧光可见15 min NF-κB激活-核转运程度较高; ELISA结果显示, 10 h之后TNF-α的水平显著高于野生株和回复株。使用TLR2阻断剂和PI-3K抑制剂, 三菌株通路活化程度均明显受抑制。【结论】荚膜唾液酸可抑制宿主免疫细胞TLR2-AKT-NF-κB信号通路的激活, 藉此参与细菌逃避宿主的免疫防御作用。
    18  一种光学显微镜下观察原生质体的染色方法
    杨世辉;方呈祥;张珞珍
    2000, 27(1).
    [摘要](5673) [HTML](8) [PDF 0.00 Byte](4591)
    摘要:
    Brevibacterium lactofermentum菌液经溶菌酶处理后分别与4种微生物染色液混合,在光学显微镜下比较观察原生质体形态的效果。结果表明;染色样品中的原生质体比未经染色的形态清晰易观察,而且显微照相效果好;其中使用草酸铵结晶紫和复红染色液的效果更佳。该方法程序简单、操作方便、效果明显,还适用于悬滴法观察菌体形态和细菌运动方式。
    19  微生物在近海氮循环过程的贡献与驱动机制
    龚骏 张晓黎
    2013, 40(1):44-58.
    [摘要](5581) [HTML](0) [PDF 652.24 K](8188)
    摘要:
    人类活动导致海岸带氮超载而富营养化, 进而引起更多的生态环境问题。在全球变化背景下, 进一步揭示微生物驱动的氮循环过程的驱动机制及贡献, 对评价与预测近海生态系统服务功能变化、管理决策等至关重要。本文介绍了固氮、氨化、硝化、反硝化、硝酸盐铵化、厌氧氨氧化过程在近海多种生境沉积物中的生物地球化学(速率、通量、贡献)与微生物生态学(功能类群丰度)特征及时空变化规律, 阐述温度、溶氧、盐度、活性溶解有机碳、无机氮、沉水植物、底栖动物活动等因素对各过程速率的影响及对各竞争性类群或过程(氨氧化细菌/氨氧化古菌, 反硝化/硝酸盐铵化/厌氧氨氧化)的调控机制, 并简析了海岸带微生物氮循环研究所面临的机遇与挑战。
    20  乳酸菌抗菌机理研究进展
    李铁军; 李爱云; 张晓峰;
    2002, 29(5).
    [摘要](5559) [HTML](6) [PDF 0.00 Byte](7471)
    摘要:
    乳酸菌的抗菌机理涉及其产生的各种代谢产物 ,包括酸性物质、乳酸菌素、二氧化碳和过氧化氢等。其中酸性物质可以消耗大量细胞能量并影响细胞膜的稳定性 ;乳酸菌素可作用于细胞膜 ,造成膜内物质和能量的泄漏。对于它们抗菌机理的认识有助于我们更好的将乳酸菌应用到食品的安全生产中。

    本期文章


    文章目录


    过刊浏览

    年份

    刊期

    浏览排行

    引用排行

    下载排行