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微生物学通报

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  • 1  4株茶树根际促生菌菌株的鉴定及促生作用
    王欢 韩丽珍
    2019, 46(3):548-562. DOI: 10.13344/j.microbiol.china.180149
    [摘要](1825) [HTML](1863) [PDF 13.81 M](88478)
    摘要:
    【背景】根际促生菌可以促进植物生长、提高植物抗性。茶树根际具有特殊的根土微生物生境,可以获得具促生作用的有益微生物。【目的】探究4株茶树根际促生菌菌株的分类地位及促生作用,筛选优良的根际促生菌菌株。【方法】通过形态、生理生化特征、16S rRNA基因序列同源性比对鉴定4株茶树根际促生菌,采用钼锑抗比色法测定溶磷量,通过比色法测定ACC脱氨酶活性、CAS法测定产铁载体能力、Salkowski法测定产IAA (Indoleacetic acid)的能力进行促生作用研究,通过盆栽实验测试白菜、空心菜、苋菜及水稻的株高及鲜重以分析促生效应。【结果】鉴定KKS-6-N1为放射型土壤杆菌(Agrobacterium radiobacter),KKS-7-N7为铜绿假单胞菌(Pseudomonas aeruginosa),GD3为Pseudomonas hunanensis,GD12为弯曲芽孢杆菌(Bacillus flexus)。固氮菌株KKS-6-N1可产铁载体;固氮菌株KKS-7-N7具有解磷及产铁载体能力,分泌的IAA含量高达101.29 mg/L;解钾菌株GD3具溶磷能力,分泌的ACC脱氨酶酶活为8.09 μmol/(mg·h),相对铁载体含量为0.31;具固氮解钾性能的菌株GD12分泌的ACC脱氨酶活性为14.46 μmol/(mg·h)。盆栽试验表明,4个菌株对白菜、空心菜、苋菜的株高和鲜重均有明显促进作用,尤以GD3效果更甚。【结论】茶树根际促生菌菌株Pseudomonas hunanensis GD3促生作用显著,具有开发成微生物菌肥的潜力。
    2  封面
    2023, 50(4):0-0.
    [摘要](152) [HTML](223) [PDF 41.68 M](34968)
    摘要:
    3  实时荧光定量PCR中内参基因的选择
    赵文静 徐洁 包秋华 陈永福 张和平
    2010, 37(12):1825-1829.
    [摘要](17527) [HTML](0) [PDF 791.56 K](27292)
    摘要:
    实时荧光定量PCR技术是分析基因表达谱的一种常用方法, 在分析中选择合适的内参基因对数据进行校正是得到可信数据的关键。以Lactobacillus helveticus H9为研究对象, 应用实时荧光定量PCR技术, 评价了5种常用内参基因ldh、recA、rpoB、gapdh和16S rRNA的表达稳定性, 通过geNorm和NormFinder程序进行数据分析, 结果表明5个候选内参基因在菌株不同的发酵时间点表达相对都较为稳定, 结合两种分析得到其中最为稳定的基因是ldh, 适合于用作后续实时荧光定量PCR试验中的内参基因。
    4  抗菌活性海洋真菌HN4-13的鉴定及其发酵优化
    郭雷 朱文成 刘玮炜 丁国伟 张越乾 张守禄 邱月 谢宇
    2013, 40(6):951-958.
    [摘要](7214) [HTML](0) [PDF 11.37 M](21887)
    摘要:
    【目的】鉴定一株来源于连云港近岸海域沉积物并具有分泌抗菌活性代谢产物的真菌菌株HN4-13, 优化其合成抗菌活性物质的发酵条件。【方法】通过形态学观察及ITS 序列分析方法对菌株HN4-13进行鉴定; 通过基础发酵培养基筛选、碳氮源及无机盐的单因素试验, 继而采用正交试验设计优化其合成抗菌活性物质的发酵条件。【结果】菌株HN4-13被鉴定为黄柄曲霉(Aspergillus flavipes), 其分泌抗菌活性产物的发酵条件为: 4%蔗糖、0.5%蛋白胨、0.1% KCl、0.06% NaH2PO4、28 °C、1%接种量、160 r/min培养9?d。【结论】实验结果为进一步分离纯化菌株HN4-13所产抗菌活性代谢产物提供了基础。
    5  草鱼出血病混合感染的嗜水气单胞菌的分离、鉴定与理化特性
    邓国成 江小燕 叶 星 刘明智 许淑英 刘礼辉 白岳强 罗 霞
    2009, 36(8):1170-1177.
    [摘要](3842) [HTML](0) [PDF 577.10 K](19108)
    摘要:
    从患出血病草鱼的肝脏病灶中分离筛选出2株致病菌。取病鱼样品组织过滤液接种CIK细胞、培养, 电镜下观察到细胞质中含有草鱼呼肠孤病毒样颗粒和包涵体, 病毒颗粒大小65 nm~ 70 nm, 包涵体0.46 μm~1.81 μm。人工回归感染实验显示分离的菌株及细胞毒悬液均能使草鱼致病死亡。对分离菌株进行细胞形态学、理化特性分析及药敏试验, 初步判定所分离的2株菌均为嗜水气单胞菌。进一步对菌株进行DNA分子鉴定, 结果显示2株菌的16S rRNA基因、促旋酶亚单位蛋白(gryB)基因均与GenBank上的嗜水
    6  云南嵩明大哨天然虫生真菌及其内生真菌的分离鉴定与抑菌活性分析
    许小蓉,黄之镨,虞泓,许玉潇,张冰,张科涛,刘朝金,赵庆,张晓梅
    2022, 49(10):4048-4065. DOI: 10.13344/j.microbiol.china.220180
    [摘要](422) [HTML](713) [PDF 1.76 M](17297)
    摘要:
    【背景】云南存在着丰富的虫草资源,天然虫草群落中蕴藏多样的真菌资源,是挖掘新型抑菌活性化合物的潜在来源。【目的】了解云南嵩明大哨天然虫生真菌及其内生真菌的物种多样性,并从中筛选具有抑菌活性的菌株。【方法】采用组织分离法对所采集的野生虫草样本进行虫生真菌及其内生真菌的分离,并通过形态观察和ITS联合nrSSUnrLSUtef-1αrpb1rpb2多基因测序进行物种鉴定及多样性分析;通过平板对峙法以7株病原细菌、5株植物病原真菌为病原指示菌进行抑菌活性测试。【结果】共采集86份天然虫草样本,经鉴定隶属于3科5属7种,包括虫草科(Cordycipitaceae)虫草属(Cordyceps)(1种)、白僵菌属(Beauveria)(2种)、鳞翅虫草属(Samsoniella)(2种)、麦角菌科(Clavicipitaceae)泛普可尼亚属(Metapochonia)(1种),以及线虫草科(Ophiocordycipitaceae)线虫草属(Ophiocordyceps)(1种)。同时,从采集到的虫草样本中分离得到26株内生真菌,分属于9科9属,其中木霉属(Trichoderma)(38%)和镰刀菌属(Fusarium)(19%)为此次分离得到的优势菌属。对所分离保存的真菌按其分离源及种类归属,从虫生真菌和内生真菌菌株中共挑取20株代表性菌株进行抑菌活性筛选,有11株真菌对2株及以上病原指示细菌具有不同程度的抑菌活性,13株真菌对1株以上植物病原真菌具有不同程度拮抗能力;其中Trichoderma sp.Y3-1和Fusarium sp.WZ3-1具有广谱抑菌活性。【结论】云南嵩明大哨分布有丰富的虫生真菌及内生真菌资源,分离所得的真菌对多种病原菌具有不同程度的抑制作用。本研究丰富了云南虫草资源多样性,为云南省虫草及其内生真菌资源的开发利用提供了数据支持,也为下一步从虫草及其相关真菌资源中挖掘抑菌活性物质提供了菌株资源。
    7  Clostridium thermocellum与Bacillus licheniformis共培养分解纤维素的性质
    姚义 吕育财 龚艳丽 邓志威 李宁 郭金玲 田毅红 龚大春
    2017, 44(10):2361-2369. DOI: 10.13344/j.microbiol.china.160934
    [摘要](1867) [HTML](740) [PDF 664.12 K](17001)
    摘要:
    【目的】采取人工构建复合菌系的方法探索微生物协同降解纤维素的机理及菌间关系。【方法】从一组高温发酵木质纤维素原料产沼气的菌群中分离获得若干菌株,其中一株细菌经16S rRNA基因全序列测序比对后鉴定为地衣芽孢杆菌(Bacillus licheniformis),将该菌株与厌氧纤维素分解菌Clostridium thermocellum CTL-6进行共培养,菌株组合表现出很强的滤纸纤维素分解能力。【结果】两菌共培养9 d,累计滤纸分解量为484.6 mg,滤纸相对分解率高达93.2%;pH变化呈先下降后逐步回升,培养3 d后pH由初始时的7.00降到最低值6.57,第9天升至7.73;菌株组合能同时产生纤维素酶和半纤维素酶,培养过程中两种酶活性大小均呈不断上升趋势,最大值分别为0.32 U/mL和0.57 U/mL。利用HPLC监测了乳酸、甲酸、乙酸、丙酸和丁酸5种有机酸含量的变化,其中丁酸、丙酸代谢量最高,分别为1 477.3 mg/L和1 068.8 mg/L;除丙酸外,其他4种有机酸含量变化趋势与滤纸降解的变化均无明显相关性。5种有机酸总含量的变化与pH的变化趋势一致,表明对pH变化起决定性作用的很可能是某种未检测的酸性较强的物质含量变化。【结论】Bacillus licheniformis能有效促进Clostridium thermocellum CTL-6的纤维素分解活性,且该菌株组合可作为后期进一步构建纤维素甲烷转化复合菌系的基础。
    8  黑龙江省水稻穗褐变病病原菌的分离与鉴定
    台莲梅,姜小玉,靳学慧,张亚玲
    2020, 47(6):1776-1786. DOI: 10.13344/j.microbiol.china.190828
    [摘要](481) [HTML](1671) [PDF 11.39 M](15479)
    摘要:
    【背景】黑龙江省水稻穗褐变病发生较普遍,可造成减产和稻米的品质下降。【目的】明确黑龙江省水稻穗褐变病的主要致病菌。【方法】从不同水稻产区采集水稻穗褐变的病样,进行病原菌组织分离和纯化,根据柯赫氏法则确定致病的病原菌,用形态学和分子生物学相结合的方式进行病原菌种类鉴定。【结果】分离出4种主要的菌,进行致病性测定表现出与田间自然发病一致的症状;经形态特征与rDNA ITS序列分析将4种病原菌鉴定为禾谷镰孢菌(Fusarium graminearum Schwabe)、链格孢[Alternaria alternata (Fr.) Keissler]、稻黑孢霉(Nigrospora oryzae Petch)、黑附球菌(Epicoccum nigrun Link);不同年度间病原菌的优势菌存在差异。【结论】黑龙江省水稻穗褐变病原真菌的鉴定可为开展病害防治工作提供参考。
    9  反硝化细菌在污水脱氮中的作用
    辛明秀 赵颖 周军 高文臣
    2007, 34(4):0773-0776.
    [摘要](3222) [HTML](0) [PDF 0.00 Byte](14608)
    摘要:
    反硝化是在反硝化细菌的作用下,以硝酸盐作为最终电子受体而进行的无氧呼吸过程。从污水脱氮的角度论述反硝化在污水脱氮中的作用、污水脱氮的机理、污水脱氮过程中反硝化作用的影响因素等。从反硝化的角度出发,论述了反硝化细菌的类群、反硝化作用的机理、反硝化细菌细胞中参与反硝化过程的关键酶。另外,还论述了近年来发现的有氧反硝化细菌、自养反硝化细菌及反硝化除磷细菌等方面的研究进展。
    10  枯草芽孢杆菌(Bacillus subtilis)发酵生产乙偶姻的pH调控策略
    郝飞 吴群 徐岩
    2013, 40(6):921-927.
    [摘要](1922) [HTML](0) [PDF 11.59 M](14544)
    摘要:
    【目的】为了提高Bacillus subtilis CCTCC M 208157发酵生产乙偶姻的效率。【方法】在7 L发酵罐水平上考察不同pH条件对菌株生长及乙偶姻合成的影响。【结果】pH对菌株合成乙偶姻有显著影响, pH 4.5有利于细胞合成乙偶姻, 但是延迟期较长; pH 5.5时菌株生长较快, 但乙偶姻的产量偏低。因此提出了两阶段pH控制策略: 发酵前期(0?16?h), 控制pH 5.5; 发酵中后期(16?72 h), 控制pH 4.5。【结论】通过此策略, 菌株合成乙偶姻的能力得到进一步提高, 乙偶姻的产量、产率和生产强度分别为32.7 g/L、0.41?g/g和0.91 g/(L·h), 分别比初始发酵条件下提高了41%、42%和69%。
    11  土壤细菌DNA提取及多样性分析的T-RFLP方法
    葛芸英 陈 松 胡 兰 凃 政
    2008, 35(1):131-136.
    [摘要](8851) [HTML](8) [PDF 0.00 Byte](14134)
    摘要:
    获得高质量的土壤总DNA是土壤细菌生态学的关键步骤之一。实验通过综合应用两个试剂盒(Soilmaster kit和DNA IQTM系统)的优点进行土壤样品总DNA的提取, 结果证明该方法是一种快速、有效、灵敏、稳定的土壤DNA提取方法。另外尝试将16S rDNA 序列和T-RFLP(Terminal restriction fragment length polymorphism)技术引入土壤细菌DNA群落多样性的研究中, 证明T-RFLP是一种有力的土壤细菌多样性分析工具。
    12  环境因素对细菌群体感应的影响
    周宁一
    2015, 42(2):436-436. DOI: 10.13344/j.microbiol.china.158002
    [摘要](4455) [HTML](749) [PDF 156.56 K](14016)
    摘要:
    13  SCI收录的微生物科学期刊信息
    李 红
    2008, 35(6):0967-0976.
    [摘要](15258) [HTML](0) [PDF 0.00 Byte](13248)
    摘要:
    以SCI期刊引用报告JCR最新网络版 (2006年) 为依据, 对其收录的88种微生物科学期刊进行了统计分析。结果显示:这88种期刊由美、英、荷兰、德和日本等16个国家用3种语言出版, 且主要语言是英语; 年均载文量165篇, 平均被引频次5226.64次; 影响因子、即时指标和被引半衰期的平均值分别为3.154、0.45和5.84年。最后根据影响因子的大小, 列出影响因子超过2.0的55种核心期刊相关信息。
    14  转醛醇酶基因差异表达影响酵母发酵木糖及耐受乙酸性能
    肖琴 曾维怡 汤岳琴 木田建次
    2014, 41(6):1094-1108. DOI: 10.13344/j.microbiol.china.130856
    [摘要](4511) [HTML](0) [PDF 11.12 M](12632)
    摘要:
    【目的】木糖发酵是纤维素燃料乙醇生产的一个关键瓶颈,同时木质纤维素水解液中的乙酸严重抑制酿酒酵母的木糖发酵过程,因此通过基因工程手段提高菌株对木糖的利用以及对乙酸的耐受性具有重要意义。本研究以非氧化磷酸戊糖途径(PPP途径)中关键基因转醛醇酶基因(TAL1)为研究对象,探讨了3种不同启动子PTDH3、PAHP1和PUBI4,控制其表达对菌株利用木糖和耐受乙酸的影响。【方法】通过同源重组用3种启动子替换酿酒酵母基因工程菌NAPX37的TAL1基因的启动子PTAL1,再通过孢子分离和单倍体交配构建了纯合子,利用批次发酵比较了在以木糖为唯一碳源和混合糖(葡萄糖和木糖)为碳源条件下,3种启动子控制TAL1基因表达导致的发酵和乙酸耐受能力的差异。【结果】启动子PTDH3、PAHP1和PUBI4在不同程度上提高了TAL1基因的转录水平,提高了菌株对木糖的利用速率及乙酸耐受能力,提高了菌株在60 mmol/L乙酸条件下的葡萄糖利用速率。在以木糖为唯一碳源且无乙酸存在、以及混合糖为碳源的条件下,PAHP1启动子控制TAL1表达菌株的发酵结果优于PTDH3和PUBI4启动子的菌株,PAHP1启动子控制的TAL1基因的转录水平比较合适。在木糖为唯一碳源且乙酸为30 mmol/L时,PUBI4启动子控制TAL1基因表达的菌株发酵结果则优于PAHP1和PTDH3启动子菌株,此时PUBI4启动子控制的TAL1的转录水平比较合适。【结论】启动子PTDH3、PAHP1和PUBI4不同程度地提高TAL1基因的表达,在不同程度上改善了酵母菌株的木糖发酵速率和耐受乙酸性能,改善程度受发酵条件的影响。
    15  以比生长速率时间曲线为基础的生物群体生长数学模型
    宋健 林建群 金燕 沈红 林慧彬 林建强 曲音波
    2007, 34(5):0836-0838.
    [摘要](2854) [HTML](0) [PDF 0.00 Byte](12608)
    摘要:
    构建了一个描述限制性环境条件下生物群体生长规律的数学模型。模型中比生长速率(μ)是时间(t)的函数。模型可以很好地拟合多种生物或生物细胞群体生长的延迟期、指数期和稳定期。该模型参数少,模型参数生物学意义明确,计算简单。
    16  荚膜唾液酸对猪链球菌激活巨噬细胞TLR2-AKT-NF-κB信号通路影响的研究
    朱静 胡丹 刘丽娜 张锦海 张凤玉 郝丽娜 耿美玲 郑峰 朱进 潘秀珍 王长军
    2013, 40(6):1058-1067.
    [摘要](4821) [HTML](0) [PDF 15.50 M](11834)
    摘要:
    【目的】探索猪链球菌2型感染后单核/巨噬细胞启动信号转导通路机制, 探讨荚膜唾液酸对细菌激活巨噬细胞TLR2-AKT-NF-κB信号通路的影响。【方法】以小鼠巨噬细胞系RAW264.7细胞为研究对象, 采用RT-PCR、Western blotting、免疫荧光和ELISA法分别检测猪链球菌2型野毒株、唾液酸缺失突变株、唾液酸回复突变株感染后不同时间点巨噬细胞TLR2 mRNA转录水平、AKT磷酸化水平、NF-κB激活程度以及前炎症因子TNF-α分泌水平; 再分别用TLR2阻断剂和PI-3K抑制剂预处理巨噬细胞, 检测上述分子的表达水平。【结果】唾液酸缺失株可选择性的活化信号转导通路途径。RT-PCR结果表明, 缺失株TLR2 mRNA表达水平自1 h开始升高, 1.5 h达高峰后有所下降; Western blotting显示, 缺失株TLR2蛋白表达水平7 h达高峰, 9 h下降; p-AKT 水平1.5?5 h持续稳定在高峰水平, 7 h后开始下降; 免疫荧光可见15 min NF-κB激活-核转运程度较高; ELISA结果显示, 10 h之后TNF-α的水平显著高于野生株和回复株。使用TLR2阻断剂和PI-3K抑制剂, 三菌株通路活化程度均明显受抑制。【结论】荚膜唾液酸可抑制宿主免疫细胞TLR2-AKT-NF-κB信号通路的激活, 藉此参与细菌逃避宿主的免疫防御作用。
    17  辅助噬菌体在噬菌体展示中的应用及研究进展
    杜东霞 张 冉
    2009, 36(2):0261-0266.
    [摘要](3888) [HTML](0) [PDF 388.00 K](11463)
    摘要:
    噬菌体展示技术是一种将外源肽或蛋白质与特定噬菌体衣壳蛋白相融合,展示于噬菌体表面来构建蛋白质或多肽文库,并从中筛选目的蛋白、多肽或抗体的基因工程高新技术。噬菌粒/辅助噬菌体系统是最常用的噬菌体展示系统,此系统中辅助噬菌体对噬菌粒的复制和组装发挥着至关重要的作用。本文结合当今该领域的最新研究动态,概述了噬菌粒和辅助噬菌体双基因组系统,着重介绍了不同辅助噬菌体的特点及其突变机制,并对其应用前景进行了展望,以期为该技术的进一步完善提供一定的借鉴作用。
    18  病毒入胞机制研究方法及其研究进展
    孙芳 李玉霞 凌焱 梁龙 陈珊 陈惠鹏
    2010, 37(1):0103-0111.
    [摘要](2839) [HTML](0) [PDF 793.85 K](11205)
    摘要:
    多数病毒家族利用胞吞作为入侵宿主细胞的途径。胞吞既可以介导病毒内化, 也可以将病毒运输到复制位点。已知的胞吞途径包括: 网格蛋白依赖型内吞、小窝蛋白依赖型内吞、巨胞饮和网格蛋白、小窝蛋白非依赖型内吞。随着对胞吞过程中各组分结构和功能了解的日趋深入, 研究胞吞过程以及病毒入侵过程的手段也变得更有效, 特异性更高。目前, 化学抑制剂的使用仍十分普遍, 但该方法常非特异性地阻断细胞某些功能。一些分子抑制方法, 如过表达显性负突变体和siRNA技术等, 因其对单一途径的特异性阻断, 使得应用分子型抑制剂逐渐取代了化学抑制剂。本文主要分析了研究病毒入侵途径时所使用的实验方法, 并列举了一些实例。
    19  细菌素的合成与作用机制
    吴清平 黄静敏 张菊梅 莫树平
    2010, 37(10):1519-1524.
    [摘要](3791) [HTML](0) [PDF 510.00 K](10917)
    摘要:
    细菌素是由细菌产生的抗菌蛋白, 可以杀死与产生菌相近的细菌。很多乳酸菌产生不同多样性的细菌素, 虽然这些细菌素都是由发酵或非发酵食品中发现的乳酸菌产生的, 但是迄今只有乳酸链球菌素(Nisin)作为食品防腐剂被广泛应用。和抗生素不同的是, 细菌素由核糖体合成, 需经翻译后修饰活化并且通过特定转运系统输到胞外才能发挥其功能, 它一般通过作用于靶细胞膜来抑制靶细胞的生长, 同时本身合成细菌素的细胞对其产物具有免疫性。细菌素能安全有效地抑制病原体生长, 在食品行业中具有广阔的应用前景。
    20  农牧交错带草地土壤剖面微生物总量、多样性和互作网络的垂直分布特征
    杜雄峰,厉舒祯,冯凯,何晴,王朱珺,吴悦妮,王丹蕊,彭玺,王尚,邓晔
    2020, 47(9):2789-2806. DOI: 10.13344/j.microbiol.china.200465
    [摘要](724) [HTML](3070) [PDF 3.35 M](10858)
    摘要:
    【背景】草地土壤微生物是维持草地生态系统功能和稳定的关键要素之一,探寻微生物在土壤剖面的垂直分布特征和构建规律对于理解其在草地生态系统的作用至关重要。【目的】在80 cm深的土壤剖面内,全面分析微生物的总量、多样性和物种间的相互作用网络表现出的垂直分布特征。【方法】基于内蒙古农牧交错带上典型草原土壤中原核微生物的定量和高通量测序数据,比较微生物的总量和多样性,使用分子生态网络方法(molecular ecological network approach,MENA)探究微生物相互作用网络的垂直变化。【结果】原核生物的总量和多样性随深度增加而逐渐降低,且群落结构变异沿土壤剖面逐渐增大。网络结构在表层最为复杂,微生物物种间联系紧密;随着深度的增加,微生物间紧密的关联会逐渐变稀疏,网络结构变得简单。此外,酸杆菌是当地土壤生态系统中的优势种群以及网络核心微生物物种,可能对土壤生态服务功能的稳定发挥具有重要的作用。【结论】原核微生物的总量、多样性和物种间的互作网络都表现出高度一致的垂直变化规律,即总量、多样性与深度成负相关,且其群落结构变异会逐渐扩大,同时微生物网络相关性会减弱。这些结果为我们提供了微生物动态变化的重要见解,对典型农牧交错带草地的生态保护具有一定的参考价值。

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